RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC01551Q86U37 167 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF546Q86UE3 836 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR2DL5AQ8N109 375 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4F15Q8NGB8 312 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 OR10G9Q8NGN4 311 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 GIMAP1Q8WWP7 306 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CXorf40BQ96DE9 158 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 STARD4Q96DR4 205 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SRMSQ9H3Y6 488 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CLMPQ9H6B4 373 aa2.35□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 GLRX2Q9NS18 164 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 GIN1Q9NXP7 522 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 DEC1Q9P2X7 70 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 HPCAL4Q9UM19 191 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 H0YCG3 227 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 DFNA5O60443 496 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SPAG6O75602 509 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SNX4O95219 450 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 NCK1P16333 377 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC26A3P40879 764 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 OPRD1P41143 372 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CCT3P49368 545 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00315P59091 139 aa2.34□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 GGTLC2Q14390 218 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL38Q2WGJ6 581 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 FILIP1LQ4L180 1135 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PDZK1Q5T2W1 519 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ECHDC2Q86YB7 292 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PIANPQ8IYJ0 282 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ACOT4Q8N9L9 421 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MCOLN3Q8TDD5 553 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SCFD1Q8WVM8 642 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SHC3Q92529 594 aa2.34□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 LY9Q9HBG7 655 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFP14Q9HCL3 533 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 POLE4Q9NR33 117 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 BFARQ9NZS9 450 aa2.34□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 GNPTGQ9UJJ9 305 aa2.34□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 FANCIQ9NVI1 1328 aa2.34□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5B21A6NL26 309 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 C11orf94C9JXX5 98 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC31A2O15432 143 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 HPGDP15428 266 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK16Q00536 496 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 REG3AQ06141 175 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 FGL1Q08830 312 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 RFX4Q33E94 735 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM255AQ5JRV8 349 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 RGS9BPQ6ZS82 235 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM69Q86WT6 500 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 FNDC5Q8NAU1 212 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5D13Q8NGL4 314 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF596Q8TC21 504 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 DTX3LQ8TDB6 740 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CNDP1Q96KN2 507 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP170P1Q96L14 293 aa2.33□□□□□ -2.04
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RABGGTB-202ENST00000370826 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 GORASP2Q9H8Y8 452 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF226Q9NYT6 803 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CALYQ9NYX4 217 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAM28Q9UKQ2 775 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CDH9Q9ULB4 789 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP17Q9ULZ9 603 aa2.33□□□□□ -2.04
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RABGGTB-202ENST00000370826 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC169A6NNP5 214 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR89AB7ZAQ6 455 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 UBXN8O00124 270 aa2.32□□□□□ -2.04
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