RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC47A1Q96FL8 570 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF347Q96SE7 839 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF607Q96SK3 696 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TXN2Q99757 166 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FER1L5A0AVI2 2057 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL12A1Q99715 3063 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR6C65A6NJZ3 312 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DUXAA6NLW8 204 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HSPB2A8KAH6 182 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OGG1O15527 345 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GMFGO60234 142 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FCMRO60667 390 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FKBP6O75344 327 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACP2P11117 423 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CEACAM1P13688 526 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANPEPP15144 967 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP6V1C1P21283 382 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DUSP1P28562 367 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RORAP35398 523 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOLR3P41439 243 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GZMMP51124 257 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CRISP3P54108 245 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPS15P62841 145 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CXADRP78310 365 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPOCK1Q08629 439 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIP10Q15642 601 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HSPB2Q16082 182 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AARDQ4LEZ3 155 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYBRD1Q53TN4 286 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LCN8Q6JVE9 175 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C5orf30Q96GV9 206 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNX18Q96RF0 628 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LPAR4Q99677 370 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UGT2B28Q9BY64 529 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WNT5BQ9H1J7 359 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOLH1BQ9HBA9 442 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CTPS2Q9NRF8 586 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C14orf105Q9NVL8 296 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MALT1Q9UDY8 824 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR45Q9Y484 360 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 U3KQV3 271 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNTNA6NMZ2 147 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM77I1YAP6 450 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFNA14P01570 189 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADH4P08319 380 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HPGDP15428 266 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCGF2P35227 344 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DLSTP36957 453 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EMDP50402 254 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NCF4Q15080 339 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TGIF1Q15583 401 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CEBPEQ15744 281 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q3ZCU0 254 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPATS1Q496A3 300 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AQP12AQ8IXF9 295 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF565Q8N9K5 539 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDRT4Q8N9R6 151 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSMA8Q8TAA3 256 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CT55Q8WUE5 264 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPSB1Q96BD6 273 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZG16BQ96DA0 208 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARSGQ96EG1 525 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SAMD8Q96LT4 415 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PKP2Q99959 881 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZPBPQ9BS86 351 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHID1Q9BWS9 393 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEK6Q9HC98 313 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DHDHQ9UQ10 334 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHD6Q8TD26 2715 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms