RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339365.2

SEC24C-201, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEC24C, Length 4,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-201ENST00000339365 KIRREL2Q6UWL6 708 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 OR5AK2Q8NH90 309 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 ALG12Q9BV10 488 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 EMC6Q9BV81 110 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 TGIF2Q9GZN2 237 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM138Q9NPI0 162 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 ATP23Q9Y6H3 246 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 FAM183AA6NL82 134 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 CT62P0C5K7 136 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 FUT4P22083 530 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 ARRB2P32121 409 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 TBPL2Q6SJ96 375 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 SLC22A25Q6T423 547 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 PDSS2Q86YH6 399 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 EXTL1Q92935 676 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 RAD51DO75771 328 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 PTGER4P35408 488 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 GLP1RP43220 463 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 USP43Q70EL4 1123 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 Q96M85 177 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 FOXN4Q96NZ1 517 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 RAB9BQ9NP90 201 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 FOXJ2Q9P0K8 574 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 HHLA2Q9UM44 414 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 H7C1C5 153 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 CCRL2O00421 344 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 STSP08842 583 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 NR4A1P22736 598 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 SLC37A1P57057 533 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 LCN6P62502 163 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 PIGFQ07326 219 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 MFSD8Q8NHS3 518 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM163Q8TC26 289 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 GPR148Q8TDV2 347 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 SGCDQ92629 289 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 EGLN3Q9H6Z9 239 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 CRLF2Q9HC73 371 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SEC24C-201ENST00000339365 CLDN24A6NM45 220 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 CBX3Q13185 183 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 RSU1Q15404 277 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 ASRGL1Q7L266 308 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 ZFP3Q96NJ6 502 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 ALG8Q9BVK2 526 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 PEX16Q9Y5Y5 336 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 ARR3P36575 388 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 EMDP50402 254 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 PITPNAQ00169 270 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 NHLH1Q02575 133 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 KEAP1Q14145 624 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 GIMAP5Q96F15 307 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 COG8Q96MW5 612 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 NMNAT3Q96T66 252 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 GPATCH2Q9NW75 528 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SEC24C-201ENST00000339365 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms