RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 CD276Q5ZPR3 534 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 OGFOD3Q6PK18 319 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 OR8D2Q9GZM6 311 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 PCED1AQ9H1Q7 454 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 V9GY05 133 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 HSPB2A8KAH6 182 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 LMO7DNF2Z398 122 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 OR2B3O76000 313 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF432O94892 652 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 RENP00797 406 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV3-11P04433 115 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP17.8■□□□□ 0.442e-9■■■■□ 25.2
SPNS1-201ENST00000311008 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 HSPB2Q16082 182 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 TIGD4Q8IY51 512 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 CMTM4Q8IZR5 234 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF511Q8NB15 262 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 HSD17B8Q92506 261 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 CLIP3Q96DZ5 547 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 PLEKHA1Q9HB21 404 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 EMC7Q9NPA0 242 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ING4Q9UNL4 249 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 HEATR5AQ86XA9 2040 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 TRAV6A0A075B6T7 132 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 TRABD2BA6NFA1 517 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 SULT1B1O43704 296 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ECDO95905 644 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 TACR3P29371 465 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 Q499Y3 187 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 APOOLQ6UXV4 268 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 TTLL10Q6ZVT0 673 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 CREB3L2Q70SY1 520 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 BTN2A1Q7KYR7 527 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 CDC20BQ86Y33 519 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ADIPOR1Q96A54 375 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 TPSD1Q9BZJ3 242 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 PTTG3PQ9NZH4 202 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 UNC80Q8N2C7 3258 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 RHPN2P1A8MT19 583 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 PHYHO14832 338 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 RAB40ALP0C0E4 278 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 CALCBP10092 127 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 SRFP11831 508 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 MST1P26927 711 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 GIFP27352 417 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 AP3S2P59780 193 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 C14orf28Q4W4Y0 310 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 FAM69AQ5T7M9 428 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF321PQ8N8H1 164 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 OR5AK2Q8NH90 309 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 C15orf40Q8WUR7 153 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 DEDD2Q8WXF8 326 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 RAB40AQ8WXH6 277 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ADOQ96SZ5 270 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 EMC3Q9P0I2 261 aa17.79■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PQD3 144 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM72A0PK05 275 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ACOD1A6NK06 481 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 FAM171A2A8MVW0 826 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 UPK3AO75631 287 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 IL12BP29460 328 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 LTBQ06643 244 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 EGR3Q06889 387 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 FCN2Q15485 313 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 SNAP47Q5SQN1 464 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 C6orf183Q5T699 404 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 CADM4Q8NFZ8 388 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF721Q8TF20 911 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 KLHL15Q96M94 604 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 OR51J1Q9H342 316 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 TCF7L1Q9HCS4 588 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD34BA5PLL1 514 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 NAP1L6A6NFF2 107 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 A6NL46 340 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 IDSB3KWA1 339 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 TPPPO94811 219 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 DDAH2O95865 285 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 F13BP05160 661 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 DPP4P27487 766 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 GRPRP30550 384 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 BTBD16Q32M84 506 aa17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms