RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 NTN4Q9HB63 628 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM18P0DKX4 95 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SLX4IPQ5VYV7 408 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 NLRP8Q86W28 1048 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 A6NL46 340 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 M0QYG6 137 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 DOK2O60496 412 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 FPR3P25089 353 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC16A14Q7RTX9 510 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNG3Q8TAE7 436 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 MS4A8Q9BY19 250 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 OR1D4P47884 311 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 FRMD1Q8N878 549 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CLDN17P56750 224 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 PLPP5Q8NEB5 264 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF416Q9BWM5 594 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM38AQ9H6F2 299 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ELK1P19419 428 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC51BQ86UW2 128 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 TSSK2Q96PF2 358 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBB1Q9H4B7 451 aa22.38■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 HBE1P02100 147 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 TGFBR3Q03167 851 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 RFLNAQ6ZTI6 216 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52N1Q8NH53 320 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 AMDHD1Q96NU7 426 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SELENOIQ9C0D9 397 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CA5BQ9Y2D0 317 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB19A4D1S5 217 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CNR1P21554 472 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 VRK3Q8IV63 474 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 PLSCR5A0PG75 271 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 PMP2P02689 132 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 PDGFAP04085 211 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CA3P07451 260 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM23P36406 574 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.178e-7■■□□□ 12.3
GNPTAB-201ENST00000299314 C9orf135Q5VTT2 229 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 GLIPR2Q9H4G4 154 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 LRIT2A6NDA9 550 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 P2RY10O00398 339 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC36A2Q495M3 483 aa22.37■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SYT5O00445 386 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 NAGAP17050 411 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDT1P36639 197 aa22.36■■□□□ 1.17
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GNPTAB-201ENST00000299314 TEX37Q96LM6 180 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 UHRF2Q96PU4 802 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 EMC9Q9Y3B6 208 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 TRABD2BA6NFA1 517 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 PCSK6P29122 969 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 IKZF1Q13422 519 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 Q6ZTK2 550 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 GABRA2P47869 451 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM8Q8N371 416 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A087WUU8 490 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GWA3 101 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF728P0DKX0 622 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 APEHP13798 732 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC22A24Q8N4F4 322 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 MCRIP1C9JLW8 97 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 NSA2O95478 260 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP1B1P05026 303 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SRP9P49458 86 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CATR1Q13166 79 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 RNLSQ5VYX0 342 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 C5orf46Q6UWT4 87 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 OR5D18Q8NGL1 313 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SEC22CQ9BRL7 303 aa22.36■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS19P39019 145 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.35■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF836Q6ZNA1 936 aa22.35■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 DMBX1Q8NFW5 382 aa22.35■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SECTM1Q8WVN6 248 aa22.35■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.35■■□□□ 1.17
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