RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 IL5P05113 134 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 OR8G3PP0DMU2 310 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HSD11B1P28845 292 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GALNSP34059 522 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TPMTP51580 245 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PER3P56645 1201 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 IFITM2Q01629 132 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GLO1Q04760 184 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CMTM4Q8IZR5 234 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 FKRPQ9H9S5 495 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 C12orf10Q9HB07 376 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GOSR2O14653 212 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PTP4A3O75365 173 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PPP3CBP16298 524 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CD79BP40259 229 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 FGL2Q14314 439 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SMCO1Q147U7 214 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MED25Q71SY5 747 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GLCCI1Q86VQ1 547 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MIB2Q96AX9 1013 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GPER1Q99527 375 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MENTQ9BUN1 341 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GLTPQ9NZD2 209 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SMLR1H3BR10 107 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CTSVO60911 334 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 RGS11O94810 467 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 IFNGR1P15260 489 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ARL14Q8N4G2 192 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 OR13H1Q8NG92 308 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SLC37A2Q8TED4 501 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 RASD2Q96D21 266 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HAVCR1Q96D42 359 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ARL6Q9H0F7 186 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HRO43593 1189 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HCRTR1O43613 425 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TOXO94900 526 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 LALBAP00709 142 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TACR3P29371 465 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PPICP45877 212 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ODF4Q2M2E3 257 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 RAB12Q6IQ22 244 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PRRT1Q99946 306 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SCPEP1Q9HB40 452 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CENPMQ9NSP4 180 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HHLA2Q9UM44 414 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TLCD2A6NGC4 264 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 UBBP0CG47 229 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R31P59538 309 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 EFNB1P98172 346 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PLA1AQ53H76 456 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 BEST3Q8N1M1 668 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 OR8S1Q8NH09 359 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SMIM10Q96HG1 83 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MFRPQ9BY79 579 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
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