RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa23.99■■□□□ 1.43
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CAPNS1-201ENST00000246533 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
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CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC116Q8IYX3 515 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 SAMD12Q8N8I0 201 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52L1Q8NGH7 329 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5W2Q8NH69 310 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ELP4Q96EB1 424 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf58Q96GQ5 468 aa23.99■■□□□ 1.43
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CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa23.98■■□□□ 1.43
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CAPNS1-201ENST00000246533 ALOX12BO75342 701 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGA10O75578 1167 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAPC5O75971 98 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 RAF1P04049 648 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 BTCP35070 178 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 SSPNQ14714 243 aa23.97■■□□□ 1.43
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CAPNS1-201ENST00000246533 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa23.97■■□□□ 1.43
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CAPNS1-201ENST00000246533 MMP15P51511 669 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 INSL4Q14641 139 aa23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A12Q8TD20 617 aa23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-201ENST00000246533 KCNN3Q9UGI6 736 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 RASD1Q9Y272 281 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-201ENST00000246533 TCRBP04435 133 aa23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-201ENST00000246533 HMGN2P46Q86SG4 172 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 CMIPQ8IY22 773 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF680Q8NEM1 530 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS15Q8TE58 950 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 CMTM3Q96MX0 182 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 LANCL1O43813 399 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 FZD7O75084 574 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 THBS1P07996 1170 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A10Q63ZE4 541 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 KIRREL2Q6UWL6 708 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 LANCL3Q6ZV70 420 aa23.95■■□□□ 1.42
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