RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030117.4

Smu1-201, Transcript of WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smu1, Length 2,418 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rab14Q91V41 215 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 B3galnt1Q920V1 331 aa16.47■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mrpl15Q9CPR5 295 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 BambiQ9D0L6 260 aa16.47■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Derl3Q9D8K3 228 aa16.47■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tex44Q9DA60 530 aa16.47■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 SmpxQ9DC77 85 aa16.47■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 SpastQ9QYY8 614 aa16.47■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ajm1A2AJA9 974 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 PhyhO35386 338 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fcer1aP20489 250 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cxcl5P50228 132 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Acyp2P56375 106 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 S100a1P56565 94 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tspan5P62080 268 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rps15aP62245 130 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pou3f4P62515 361 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 BglapP86546 95 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Bglap2P86547 95 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sox9Q04887 507 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Frg2f1Q6P3A2 227 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Timd4Q6U7R4 343 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 HeltQ7TS99 240 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Adam30Q811Q3 732 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rdh1Q8CGV4 317 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tmem218Q9CQ44 115 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Q9CQF4 240 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Coro1bQ9WUM3 484 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mocs2Q9Z223 189 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Lrit3W8DXL4 681 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Spag17Q5S003 2320 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 AgmatA2AS89 358 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Lao1B1ARV3 523 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tmco2P0C1V4 183 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Spi1P17433 272 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cox4i1P19783 169 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 AhrP30561 848 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cnn2Q08093 305 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 RgmaQ6PCX7 454 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Olfr1463Q7TQR3 310 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Olfr1229Q7TQZ9 311 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Olfr304Q7TS03 333 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Slc38a9Q8BGD6 560 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Flrt3Q8BGT1 649 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Znf770Q8BIQ8 705 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pou6f2Q8BJI4 691 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mab21l2Q8BPP1 359 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tmem222Q8BVA2 208 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cep68Q8C0D9 733 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Lsm10Q8QZX5 122 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Vmn1r85Q8VIB8 308 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mat1aQ91X83 396 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mmp1bQ9EPL6 463 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cnot9Q9JKY0 299 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dapp1Q9QXT1 280 aa16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 HnrnpdlQ9Z130 301 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Prr23a2D3YWX5 253 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zfp945E9PYM8 794 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dok2O70469 412 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 P01851 173 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 P01852 173 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ifi204P0DOV2 619 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zp3P10761 424 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 UradQ283N4 178 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Vdac3Q60931 283 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nr0b1Q61066 472 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Krba1Q6NXZ1 1043 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 D11Wsu47eQ6PIX9 558 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 JamlQ80UL9 379 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Scml4Q80VG1 408 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Coro2bQ8BH44 480 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ankmy1Q8C0W1 906 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Slc24a3Q99PD7 645 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mrps16Q9CPX7 135 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 4930447A16RikQ9D5F6 132 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Igkv15-103A0A140T8P3 115 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 SpxD3Z752 116 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gm9493F6SVV1 192 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gm21797J3QNW5 180 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nipsnap1O55125 284 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hsd17b12O70503 312 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Acta2P62737 377 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Actg2P63268 376 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 DmwdQ08274 665 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 H2-Eb2Q3UUV9 287 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 2900092C05RikQ5I0V9 184 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dio1Q61153 257 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Scgb1c1Q7M742 95 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ddhd2Q80Y98 699 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zfand1Q8BFR6 268 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pi15Q8BS03 258 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Amdhd2Q8JZV7 409 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Grhl2Q8K5C0 625 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 BphlQ8R164 291 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mmd2Q8R189 247 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Slc22a6Q8VC69 545 aa16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Smu1-201ENSMUST00000030117 Q9D8N1 392 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42 ms