RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem74bA2AU34 232 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm11397F6V5V4 377 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Omt2aF6ZJR3 104 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tspan6O70401 245 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rit1P70426 219 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sez6l2Q4V9Z5 910 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sema3bQ62177 748 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 NovQ64299 354 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Man1c1Q6NXK9 625 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc25a40Q8BGP6 337 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lrrn3Q8CBC6 707 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Agpat4Q8K4X7 378 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 V1ra11Q8R2E6 318 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Chchd4Q8VEA4 139 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r45Q8VIC7 318 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Brix1Q9DCA5 353 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pmm2Q9Z2M7 242 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Szt2A2A9C3 3431 aa10.6□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm7714E9Q079 131 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm8159E9Q0R1 267 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dscr3O35075 297 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dok2O70469 412 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Acp2P24638 423 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Bdkrb2P32299 392 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 CdaP56389 146 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Yes1Q04736 541 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tfb2mQ3TL26 396 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc22a29Q8BWG6 551 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 MdficQ8BX65 247 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Agbl3Q8CDP0 1006 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pdcd10Q8VE70 212 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr790Q8VGJ3 322 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr539Q8VGL9 319 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr669Q8VGU9 317 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mrgpra7Q91ZC5 305 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Glyr1Q922P9 546 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ceacam18Q9D871 376 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc46a3Q9DC26 460 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1112A2ATA0 318 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm9493F6SVV1 192 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 CcnkO88874 554 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rps15aP62245 130 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cnn2Q08093 305 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr146Q60884 306 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ubfd1Q78JW9 368 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr645Q7TRQ1 315 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr598Q7TRR2 319 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmbim1Q8BJZ3 309 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 SinhcafQ8C8M1 221 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fbxw17Q8CFE8 466 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gpr1Q8K087 353 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Satb2Q8VI24 733 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gtpbp3Q923K4 492 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cir1Q9DA19 450 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Keg1Q9DCY0 295 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Herpud2Q9JJC9 404 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mrap2D3Z1Q2 207 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cdh19E9Q3A7 770 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr550E9Q544 316 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr746E9Q840 314 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 BC117090L7N257 96 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cyp4a10O88833 509 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 H2-EaP01904 255 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 P04224 255 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Klk1b9P15949 261 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Defa14P50712 85 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc35f3Q1LZI2 421 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Xkr7Q5GH64 580 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hist2h2abQ64522 130 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 TifaQ793I8 184 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1140Q7TR39 311 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1031Q7TR87 336 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ttc29Q80VM3 471 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 C1qtnf7Q8BVD7 289 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tm6sf2Q8R1J1 378 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr160Q8VGE3 309 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1226Q8VGM5 310 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 PnpoQ91XF0 261 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 C1qtnf2Q9D8U4 294 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Psma6Q9QUM9 246 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nxt1Q9QZV9 140 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Htr6Q9R1C8 440 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rarres1F6ZIS7 283 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hcrtr2P58308 460 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hoxd1Q01822 328 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Q3USZ8 430 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 H2-Eb2Q3UUV9 287 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 PfplQ5RKV8 702 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vrk1Q80X41 440 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ctxn1Q8K129 82 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr558Q8VGZ7 317 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hdac8Q8VH37 377 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Prl8a8Q9DAS4 241 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dapp1Q9QXT1 280 aa10.59□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Col9a3A2ACT7 680 aa10.58□□□□□ -0.72
Herc4-201ENSMUST00000020258 Xlr4aA2BI40 215 aa10.58□□□□□ -0.72
Herc4-201ENSMUST00000020258 Btbd2E9PUS2 523 aa10.58□□□□□ -0.72
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp994J3QM38 661 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.6 ms