Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,11■■■■□ 3,69
Tspan6O70401 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Tspan6O70401 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Tspan6O70401 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Tspan6O70401 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Tspan6O70401 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,52■■■□□ 2,8
Tspan6O70401 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Tspan6O70401 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Tspan6O70401 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Tspan6O70401 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Tspan6O70401 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Tspan6O70401 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,88■■■□□ 2,69
Tspan6O70401 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Tspan6O70401 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,39■■■□□ 2,62
Tspan6O70401 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Tspan6O70401 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Tspan6O70401 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,78■■■□□ 2,52
Tspan6O70401 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Tspan6O70401 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Tspan6O70401 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Tspan6O70401 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Tspan6O70401 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Tspan6O70401 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Tspan6O70401 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Tspan6O70401 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Tspan6O70401 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Tspan6O70401 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Tspan6O70401 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Tspan6O70401 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Tspan6O70401 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Tspan6O70401 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Tspan6O70401 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,07■■■□□ 2,4
Tspan6O70401 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
Tspan6O70401 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Tspan6O70401 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Tspan6O70401 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Tspan6O70401 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,71■■■□□ 2,35
Tspan6O70401 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Tspan6O70401 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Tspan6O70401 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Tspan6O70401 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Tspan6O70401 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Tspan6O70401 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Tspan6O70401 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Tspan6O70401 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Tspan6O70401 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Tspan6O70401 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Tspan6O70401 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Tspan6O70401 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Tspan6O70401 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Tspan6O70401 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Tspan6O70401 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Tspan6O70401 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Tspan6O70401 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Tspan6O70401 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Tspan6O70401 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Tspan6O70401 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tspan6O70401 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Tspan6O70401 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tspan6O70401 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Tspan6O70401 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Tspan6O70401 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Tspan6O70401 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Tspan6O70401 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tspan6O70401 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Tspan6O70401 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Tspan6O70401 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Tspan6O70401 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tspan6O70401 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tspan6O70401 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Tspan6O70401 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tspan6O70401 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Tspan6O70401 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tspan6O70401 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tspan6O70401 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Tspan6O70401 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tspan6O70401 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tspan6O70401 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Tspan6O70401 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tspan6O70401 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tspan6O70401 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Tspan6O70401 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tspan6O70401 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Tspan6O70401 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Tspan6O70401 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Tspan6O70401 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Tspan6O70401 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Tspan6O70401 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Tspan6O70401 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Tspan6O70401 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Tspan6O70401 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Tspan6O70401 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Tspan6O70401 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Tspan6O70401 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Tspan6O70401 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Tspan6O70401 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Tspan6O70401 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Tspan6O70401 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Tspan6O70401 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Tspan6O70401 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,4 ms