RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	SYTL3	Q4VX76	610 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	CNIH2	Q6PI25	160 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	FADS6	Q8N9I5	356 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	APH1B	Q8WW43	257 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	MYLIP	Q8WY64	445 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	TAAR8	Q969N4	342 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	MIB2	Q96AX9	1013 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SIK2	Q9H0K1	926 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	PORCN	Q9H237	461 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SERHL	Q9NQF3	203 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SMPX	Q9UHP9	88 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	WDR27	A2RRH5	827 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF726	A6NNF4	738 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	TRDC	B7Z8K6	153 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	C1QC	P02747	245 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	RLN1	P04808	185 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	CFH	P08603	1231 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC10A3	P09131	477 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	ETFA	P13804	333 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	NPBWR1	P48145	328 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	CLCN3	P51790	818 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	TDGF1P3	P51864	188 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	WNT7B	P56706	349 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	GAB1	Q13480	694 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC10A1	Q14973	349 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	RABL3	Q5HYI8	236 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	LHX8	Q68G74	356 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	TMUB2	Q71RG4	321 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	TBCK	Q8TEA7	893 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	LPAR1	Q92633	364 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	WNT2B	Q93097	391 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	ISL2	Q96A47	359 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	LRRC58	Q96CX6	371 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	KLRG1	Q96E93	195 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	NPY6R	Q99463	290 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SYT11	Q9BT88	431 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	LYRM4	Q9HD34	91 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	VNN3	Q9NY84	501 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	RHCG	Q9UBD6	479 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	DAPP1	Q9UN19	280 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	ITSN1	Q15811	1721 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	AQP7P3	A6NL99	342 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM233	B4DJY2	109 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072		F5H5T6	163 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SDHD	O14521	159 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	ITGB2	P05107	769 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	CA3	P07451	260 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	GABRB1	P18505	474 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	AVPR1A	P37288	418 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	MATK	P42679	507 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	RBBP4	Q09028	425 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	EIPR1	Q53HC9	387 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	PHF19	Q5T6S3	580 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	MTURN	Q8N3F0	131 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF480	Q8WV37	535 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NECAP1-222	ENST00000640072	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		5.67	□□□□□ -1.5

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