RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 RPL38P63173 70 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 PIGFQ07326 219 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 FUT5Q11128 374 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 CEACAM16Q2WEN9 425 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 PHYHD1Q5SRE7 291 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 OLFML2AQ68BL7 652 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 OR5P2Q8WZ92 322 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 TUBB1Q9H4B7 451 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 GPR35Q9HC97 309 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 ADPRHL2Q9NX46 363 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 GIMAP2Q9UG22 337 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-230ENST00000551968 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 C17orf100A8MU93 164 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 TIMM23O14925 209 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 ZNF432O94892 652 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 KRT16P08779 473 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 ATP4BP51164 291 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 RAG2P55895 527 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 C2orf54Q08AI8 447 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 BNIP2Q12982 314 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 TMEM225Q6GV28 225 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 IL17RDQ8NFM7 739 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 PMM1Q92871 262 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 PIF1Q9H611 641 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 TNFRSF19Q9NS68 423 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 C1RLQ9NZP8 487 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 AUP1Q9Y679 476 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 SLC22A31A6NKX4 558 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 CLDN25C9JDP6 229 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 SCN2BO60939 215 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 GPIP06744 558 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 SELEP16581 610 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 MATN1P21941 496 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 CLDN17P56750 224 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 ETF1P62495 437 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 ZNF154Q13106 437 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 FRRS1Q6ZNA5 592 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 USP51Q70EK9 711 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 RETREG3Q86VR2 466 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 SFXN5Q8TD22 340 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 MTERF3Q96E29 417 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 GAL3ST1Q99999 423 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 BEX1Q9HBH7 125 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 ZNF224Q9NZL3 707 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 NOX1Q9Y5S8 564 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 SAR1BQ9Y6B6 198 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 TENM3Q9P273 2699 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 LSM1O15116 133 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 CRCPO75575 148 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 C1QCP02747 245 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 CHRM4P08173 479 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 CD79AP11912 226 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 ZNF12P17014 697 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 MAKP20794 623 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 HTR3AP46098 478 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 SERPINB9P50453 376 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 ERVS71-1P61550 626 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 HBA1P69905 142 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 KCNJ10P78508 379 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 CAV1Q03135 178 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 NKPD1Q17RQ9 610 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 C6orf120Q7Z4R8 191 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 SLC22A9Q8IVM8 553 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 FUT8Q9BYC5 575 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 DCAF16Q9NXF7 216 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-230ENST00000551968 EMCNQ9ULC0 261 aa11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms