RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537178.5

CLIP1-209, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLIP1, Length 5,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-209ENST00000537178 RNLSQ5VYX0 342 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-209ENST00000537178 SHEQ5VZ18 495 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-209ENST00000537178 DLK2Q6UY11 383 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-209ENST00000537178 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-209ENST00000537178 OR4F15Q8NGB8 312 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-209ENST00000537178 GGHQ92820 318 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-209ENST00000537178 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-209ENST00000537178 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-209ENST00000537178 NOX4Q9NPH5 578 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-209ENST00000537178 GABRQQ9UN88 632 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-209ENST00000537178 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-209ENST00000537178 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 M0QZQ0 153 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 CTDSP2O14595 271 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 FZD7O75084 574 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 ABOP16442 354 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 GPLD1P80108 840 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 NR0B2Q15466 257 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 LIPIQ6XZB0 460 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 PIANPQ8IYJ0 282 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 NIPAL2Q9H841 368 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 OSGIN1Q9UJX0 560 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 ADAM29Q9UKF5 820 aa9.9□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 KCNK5O95279 499 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 GABRB3P28472 473 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 GABRA5P31644 462 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 TLE1Q04724 770 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 BTN1A1Q13410 526 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 IKZF1Q13422 519 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 ZNF266Q14584 549 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 OPCMLQ14982 345 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 TCTN2Q96GX1 697 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 ARV1Q9H2C2 271 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 LMAN1LQ9HAT1 526 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 ZNF264O43296 627 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 B4GAT1O43505 415 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 OMGP23515 440 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 MFAP5Q13361 173 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 HBMQ6B0K9 141 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 BAGE3Q86Y29 109 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 BAGE2Q86Y30 109 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 OR4A16Q8NH70 328 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 GAB3Q8WWW8 586 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 BADQ92934 168 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 CLMPQ9H6B4 373 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 E9PI62 339 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 GABARAPH6UMI1 98 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 PTGESO14684 152 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 ADAM23O75077 832 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 GABARAPO95166 117 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 OR2T7P0C7T2 308 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 FCGR2AP12318 317 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 OR1D4P47884 311 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 HYAL4Q2M3T9 481 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 AAED1Q7RTV5 226 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 OR2T27Q8NH04 317 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 RNF141Q8WVD5 230 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 ZNF566Q969W8 418 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 FBXL2Q9UKC9 423 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 UTRNP46939 3433 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 BTBD17A6NE02 478 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 AP1G1O43747 822 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 CLDN1O95832 211 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 HTR2CP28335 458 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 UBE2G2P60604 165 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 SLC14A2Q15849 920 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 VRK2Q86Y07 508 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 GCNT2Q8N0V5 402 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 LILRB4Q8NHJ6 448 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 ZNF480Q8WV37 535 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 SORT1Q99523 831 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-209ENST00000537178 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms