RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528908.1

TIMM10B-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 10B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM10B, Length 593 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM10B-202ENST00000528908 PMS2P3Q13401 168 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 C1DQ13901 141 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 ZNF74Q16587 644 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 SPATS1Q496A3 300 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 BEX5Q5H9J7 111 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 TSPO2Q5TGU0 170 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 GLYATQ6IB77 296 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 NIPAL3Q6P499 406 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 C22orf34Q6ZV56 151 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 SSX8Q7RTT4 187 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 UEVLDQ8IX04 471 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 DEFB107AQ8IZN7 70 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 KDM8Q8N371 416 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 OR5J2Q8NH18 312 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 BCAS4Q8TDM0 211 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 HSD17B8Q92506 261 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 NSL1Q96IY1 281 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 HS6ST2Q96MM7 605 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 CDRT15Q96T59 188 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 FKRPQ9H9S5 495 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 SLC7A10Q9NS82 523 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 B3GAT1Q9P2W7 334 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 RCE1Q9Y256 329 aa13.18□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 CIB4A0PJX0 185 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 LRRN3E7EW58 273 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 CH25HO95992 272 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 IGF2P01344 180 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 CALB2P22676 271 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 NR1H2P55055 460 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 CLDN17P56750 224 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 PUDPQ08623 228 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 STK11Q15831 433 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 FXNQ16595 210 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 P2RY8Q86VZ1 359 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 WFDC8Q8IUA0 241 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 NKAIN4Q8IVV8 208 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 OFCC1Q8IZS5 231 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 TMEM239Q8WW34 195 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 PIK3IP1Q96FE7 263 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 GORASP2Q9H8Y8 452 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 NGBQ9NPG2 151 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 NANSQ9NR45 359 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 CD300AQ9UGN4 299 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 ZNF229Q9UJW7 825 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 A4GNTQ9UNA3 340 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 EDARQ9UNE0 448 aa13.17□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 CENPEQ02224 2701 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 OR5H1A6NKK0 313 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 ENO4A6NNW6 628 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 B2RBV5 119 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 PDLIM1O00151 329 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 SIAH2O43255 324 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 RAD51DO75771 328 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 KRT33AO76009 404 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 OR6A2O95222 327 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 MT-ND1P03886 318 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 HIST1H2ABP04908 130 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 ITGA5P08648 1049 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 MPGP29372 298 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 SELENOPP49908 381 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 UGT2B15P54855 530 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 TGFBR3Q03167 851 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 TAB1Q15750 504 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 TIMM23BQ5SRD1 257 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 OR7E24Q6IFN5 339 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 CYP4Z1Q86W10 505 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 FAM156AQ8NDB6 213 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 TMEM255BQ8WV15 326 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 HIST1H2ACQ93077 130 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 MUCL1Q96DR8 90 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 FNDC11Q9BVV2 318 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 MED31Q9Y3C7 131 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 NOX1Q9Y5S8 564 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 SNX13Q9Y5W8 968 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 NOTCH2Q04721 2471 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 CACNA1DQ01668 2161 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 ZNF587BE7ETH6 402 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 MS4A18H0YCH9 400 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 PLPP3O14495 311 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 KLF4O43474 513 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 SLC43A1O75387 559 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 HPRP00739 348 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 ADORA3P0DMS8 318 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 UMPSP11172 480 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMM10B-202ENST00000528908 AHCYP23526 432 aa13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.1 ms