RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527677.1

TSTA3-207, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-207ENST00000527677 UQCRC1P31930 480 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 GSSP48637 474 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 RIPK1Q13546 671 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 RCN1Q15293 331 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ZBED5Q49AG3 693 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 TMEM99Q8N816 258 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 RND1Q92730 232 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 PKP2Q99959 881 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 GTF3C1Q12789 2109 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.93□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ZNHIT1O43257 154 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 AQP8O94778 261 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 BAG2O95816 211 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 TGM6O95932 706 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 YES1P07947 543 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ADORA3P0DMS8 318 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ANPEPP15144 967 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF43P17038 809 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 MAKP20794 623 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 PTNP21246 168 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 GPR4P46093 362 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 P2RY4P51582 365 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 SMSP52788 366 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 IST1P53990 364 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 SLC17A1Q14916 467 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 AMIGO2Q86SJ2 522 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 UEVLDQ8IX04 471 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 PRR7Q8TB68 274 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 TMEM45BQ96B21 275 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 FEVQ99581 238 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 UCK2Q9BZX2 261 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 MED12Q93074 2177 aa14.92□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF716A6NP11 495 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 NDUFB2O95178 105 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 GASTP01350 101 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 CTSSP25774 331 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 OPRM1P35372 400 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 PMPCAQ10713 525 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ALG10Q5BKT4 473 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 FAHD1Q6P587 224 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 GPAT4Q86UL3 456 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 STK32CQ86UX6 486 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 PARP8Q8N3A8 854 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ABHD3Q8WU67 409 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 ASB5Q8WWX0 329 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 RCE1Q9Y256 329 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 A0A1W2PRG6 482 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 LRRN3E7EW58 273 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 CDC42EP2O14613 210 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 RNF13O43567 381 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 PTP4A3O75365 173 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 AGAP20933 346 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 AHCYP23526 432 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 SLC6A6P31641 620 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 IL1RL1Q01638 556 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-207ENST00000527677 GUSBP1Q15486 140 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms