RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SYT7	O43581	403 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HBP1	O60381	514 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAFK	O60675	156 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MC3R	P41968	323 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DIO1	P49895	249 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ST3GAL3	Q11203	375 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	VWA2	Q5GFL6	755 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		V9GY05	133 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PPE2	198 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7EPK0	472 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR13C7	P0DN81	318 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAC2	P15153	192 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1E1	P30953	314 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NSG1	P42857	185 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIAA0040	Q15053	153 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CPO	Q8IVL8	374 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LFNG	Q8NES3	379 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RELT	Q969Z4	430 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	INTS14	Q96SY0	518 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SARG	Q9BW04	601 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		H7BY64	318 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	EMC8	O43402	210 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAJB6	O75190	326 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GALT	P07902	379 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LIMS3	P0CW19	117 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LIMS4	P0CW20	117 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSMB6	P28072	239 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	IRS1	P35568	1242 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LAS2	Q8IYD9	372 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LCN9	Q8WX39	176 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OTUB2	Q96DC9	234 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDE7B	Q9NP56	450 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PPE3	182 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TSPAN11	A1L157	253 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDHR4	A6H8M9	788 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCS	O14618	274 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LDLRAD4	O15165	306 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLK8	O60259	260 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A27	O95847	323 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACTL6A	O96019	429 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FGB	P02675	491 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEMG1	P04279	462 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ITGA5	P08648	1049 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TYRP1	P17643	537 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LAG3	P18627	525 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CR2	P20023	1033 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFS1	P28331	727 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	BMI1	P35226	326 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SNCA	P37840	140 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FXYD6P3	P58550	94 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC14A1	Q13336	389 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAB1	Q13480	694 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	INSL4	Q14641	139 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		7.57	□□□□□ -1.2

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