RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 BET1O15155 118 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 KRT13P13646 458 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 ATP6V1C1P21283 382 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 CBX1P83916 185 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 SMARCB1Q12824 385 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 VGLL4Q14135 290 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 C1orf220Q5T0J3 134 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 OR2G6Q5TZ20 316 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 C12orf56Q8IXR9 622 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 ZNF683Q8IZ20 524 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 ZNF721Q8TF20 911 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 HPF1Q9NWY4 346 aa3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
USP34-216ENST00000487547 A0A0G2JLM5 398 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 FOXH1O75593 365 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 B3GALNT1O75752 331 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 SCGNO76038 276 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 CXCL5P42830 114 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 GYG1P46976 350 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 RGS4P49798 205 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 EFNB2P52799 333 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 SLC15A2Q16348 729 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 C5orf47Q569G3 176 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 PGAP1Q75T13 922 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 NLRP9Q7RTR0 991 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 Q8N976 141 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 FNDC5Q8NAU1 212 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 DEDD2Q8WXF8 326 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 SPIN2AQ99865 258 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 MYO10Q9HD67 2058 aa3.4□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 A8MXQ7 604 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 ANGPTL7O43827 346 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 IFNB1P01574 187 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 ERVK-25P63136 954 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 C1orf61Q13536 156 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 PDK4Q16654 411 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 LINC00483Q53H64 154 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 CARD16Q5EG05 197 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 PLA2G4DQ86XP0 818 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 ANKFN1Q8N957 763 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 UBALD1Q8TB05 177 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 UBE2E3Q969T4 207 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 RNF2Q99496 336 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 NPAS2Q99743 824 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 GBA3Q9H227 469 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 SLC35D1Q9NTN3 355 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 OR12D3Q9UGF7 316 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 SCN2AQ99250 2005 aa3.39□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 C12orf77C9JDV5 145 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 H3BNH8 94 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 XKRYO14609 159 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 SUPT3HO75486 399 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 RETP07949 1114 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 PCMT1P22061 227 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 UBE2AP49459 152 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 HMGCS1Q01581 520 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 ZNF546Q86UE3 836 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 RLN3Q8WXF3 142 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 UFD1Q92890 307 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 CLCC1Q96S66 551 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 ANGPT2O15123 496 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 OPN1MWP04001 364 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 LAP3P28838 519 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 GNA11P29992 359 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 BPIFB3P59826 476 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 FAM83EQ2M2I3 478 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 NADK2Q4G0N4 442 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 TTC23Q5W5X9 447 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 TTC5Q8N0Z6 440 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 VN1R2Q8NFZ6 395 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 ZFP14Q9HCL3 533 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 GIN1Q9NXP7 522 aa3.37□□□□□ -1.87
USP34-216ENST00000487547 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms