RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485943.1

USP40-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 4

Gene USP40, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-216ENST00000485943 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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USP40-216ENST00000485943 SLC43A1O75387 559 aa7.15□□□□□ -1.26
USP40-216ENST00000485943 TNFSF13O75888 250 aa7.15□□□□□ -1.26
USP40-216ENST00000485943 NTN1O95631 604 aa7.15□□□□□ -1.26
USP40-216ENST00000485943 BPNT1O95861 308 aa7.15□□□□□ -1.26
USP40-216ENST00000485943 ADAP00813 363 aa7.15□□□□□ -1.26
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USP40-216ENST00000485943 C10orf111Q8N326 155 aa7.15□□□□□ -1.26
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USP40-216ENST00000485943 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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USP40-216ENST00000485943 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.14□□□□□ -1.27
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USP40-216ENST00000485943 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.14□□□□□ -1.27
USP40-216ENST00000485943 AP1ARQ63HQ0 302 aa7.14□□□□□ -1.27
USP40-216ENST00000485943 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.14□□□□□ -1.27
USP40-216ENST00000485943 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP40-216ENST00000485943 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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