RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464263.1

RAB11FIP3-208, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RAB11FIP3, Length 329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IFNA8	P32881	189 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	VLDLR	P98155	873 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MS4A2	Q01362	244 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PMS2P3	Q13401	168 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	P2RY6	Q15077	328 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PFN4	Q8NHR9	129 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DACH2	Q96NX9	599 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	THTPA	Q9BU02	230 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ASPN	Q9BXN1	380 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FKRP	Q9H9S5	495 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FANCF	Q9NPI8	374 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CENPE	Q02224	2701 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FAM221A	A4D161	298 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SH3D21	A4FU49	640 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PDE5A	O76074	875 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IGHV3-9	P01782	118 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF43	P17038	809 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IGHV1-2	P23083	117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SSTR2	P30874	369 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23	1e-5	■□□□□ 10.6
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TRAM2	Q15035	370 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	AAED1	Q7RTV5	226 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR5J2	Q8NH18	312 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR10A4	Q9H209	315 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MUC13	Q9H3R2	512 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NANS	Q9NR45	359 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MED31	Q9Y3C7	131 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		V9GYQ6	96 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FBN2	P35556	2912 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ENO4	A6NNW6	628 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GYG2	O15488	501 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HLA-DOB	P13765	273 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RHCE	P18577	417 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ATP6V1B2	P21281	511 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TLE4	Q04727	773 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZP4	Q12836	540 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CASP12	Q6UXS9	341 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PXK	Q7Z7A4	578 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LIPH	Q8WWY8	451 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MALT1	Q9UDY8	824 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		A0A087WUU8	490 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PDLIM1	O00151	329 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ACOT8	O14734	319 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PIP5K1C	O60331	668 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR7A10	O76100	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF432	O94892	652 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DIRAS1	O95057	198 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	THBD	P07204	575 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PPP3CB	P16298	524 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FUT1	P19526	365 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	COX5A	P20674	150 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SELENOP	P49908	381 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CLDN17	P56750	224 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PRKCD	Q05655	676 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PUDP	Q08623	228 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FAP	Q12884	760 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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