RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF527Q8NB42 609 aa14.59□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 LGALS14Q8TCE9 139 aa14.59□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CMTM3Q96MX0 182 aa14.59□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 DERL3Q96Q80 235 aa14.59□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.59□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 PDE7BQ9NP56 450 aa14.59□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.59□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1B0GVT2 93 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF879B4DU55 563 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ZFPL1O95159 310 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 TCRBP04435 133 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 HPGDP15428 266 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 MAOBP27338 520 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 UQCRC1P31930 480 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CCR4P51679 360 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ALG10Q5BKT4 473 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 GKN2Q86XP6 184 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 USP34Q70CQ2 3546 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PR77 199 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 TLCD2A6NGC4 264 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ACOD1A6NK06 481 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CTDSPLO15194 276 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF264O43296 627 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 UTS2O95399 124 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 DHFRP00374 187 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ADRB1P08588 477 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SDHAP31040 664 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 MAGEB1P43366 347 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CTXN1P60606 82 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 LPAR4Q99677 370 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.58□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 A0A087WV48 116 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 H3BMH7 237 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 DCTN6O00399 190 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SCDO00767 359 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 TXNDC12O95881 172 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 FCN2Q15485 313 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 DEFB119Q8N690 84 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 MOKQ9UQ07 419 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 GRM7Q14831 915 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 COL19A1Q14993 1142 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 MAP6Q96JE9 813 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.57□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 IFITM5A6NNB3 132 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 UPK3AO75631 287 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 IGKV3-11P04433 115 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 F13BP05160 661 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 GIFP27352 417 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CD38P28907 300 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SLC6A19Q695T7 634 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 TIGD4Q8IY51 512 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 MSANTD3Q96H12 275 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 THADAQ6YHU6 1953 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1B0GTQ1 180 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM72A0PK05 275 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 A8MUA0 341 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 AIPO00170 330 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 GALK2Q01415 458 aa14.56□□□□□ -0.08
SHQ1-202ENST00000444040 KCNAB1Q14722 419 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms