RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTR1BP42025 376 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB2AP61019 212 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NAE1Q13564 534 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TGIF1Q15583 401 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf33Q6P1S2 294 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SSX6Q7RTT6 188 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 DERL3Q96Q80 235 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MARCH5Q9NX47 278 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 LRFN1Q9P244 771 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 GABARAPH6UMI1 98 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 H7C4K7 107 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO24O75426 580 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDH8O95206 1070 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPIND1P05546 499 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4Q2P0C623 313 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS13P62277 151 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF4P78317 190 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ARSIQ5FYB1 569 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52W1Q6IF63 320 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP21Q8N119 569 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL14Q8N4G2 192 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MORN4Q8NDC4 146 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX33Q8WV41 574 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF122Q9H9V4 155 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 DAPL1A0PJW8 107 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 URADA6NGE7 173 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 I3L1I5 382 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 LDLRAD4O15165 306 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC31A2O15432 143 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 GALTP07902 379 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FOLR2P14207 255 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PTNP21246 168 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGEF1-203ENST00000439720 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PFN3P60673 137 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CHAF1BQ13112 559 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 IL10RAQ13651 578 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK14Q16539 360 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 LINGO4Q6UY18 593 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 VRK3Q8IV63 474 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 APCDD1Q8J025 514 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 VN1R2Q8NFZ6 395 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SUSD6Q92537 303 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MED8Q96G25 268 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCC1Q96S66 551 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TIMP4Q99727 224 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SSX3Q99909 188 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
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RABGEF1-203ENST00000439720 MED20Q9H944 212 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGEF1-203ENST00000439720 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SURF4O15260 269 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FLRT2O43155 660 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 REM1O75628 298 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FURINP09958 794 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CLUP10909 449 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 IL11P20809 199 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 GSTM3P21266 225 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ACRV1P26436 265 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 HTR1FP30939 366 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CCR7P32248 378 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CTNNB1P35222 781 aa7.72□□□□□ -1.17
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