RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 HDHD5Q9BXW7 423 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ANKRD19PQ9H560 264 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 SEC14L4Q9UDX3 406 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 LRRN3E7EW58 273 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 hCG_2039718K7EN88 272 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 OR6A2O95222 327 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 UMPSP11172 480 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 PUDPQ08623 228 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 AAED1Q7RTV5 226 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 UBE2J2Q8N2K1 259 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 KDM8Q8N371 416 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 TRIM15Q9C019 465 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 HCFC1P51610 2035 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ENO4A6NNW6 628 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 UGT2B15P54855 530 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 VLDLRP98155 873 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 FBXW9Q5XUX1 488 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 RRM2BQ7LG56 351 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 GABRG1Q8N1C3 465 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 PIK3C3Q8NEB9 887 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 PFN4Q8NHR9 129 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 FAM222BQ8WU58 562 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 SGTBQ96EQ0 304 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 PIP5K1AQ99755 562 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 CRIM1Q9NZV1 1036 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 GPR52Q9Y2T5 361 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 PLPP3O14495 311 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 PRSS23O95084 383 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 SEMG1P04279 462 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 FABP3P05413 133 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 H1F0P07305 194 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ATP6V1B2P21281 511 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 SMIM11AP58511 58 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 MS4A2Q01362 244 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 STAC2Q6ZMT1 411 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF730Q6ZMV8 503 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 UEVLDQ8IX04 471 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ZIC4Q8N9L1 334 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 DACH2Q96NX9 599 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 IL1RAPQ9NPH3 570 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 B3GAT1Q9P2W7 334 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 PRSS50Q9UI38 385 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 MPDZO75970 2070 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 A0A1W2PRQ8 180 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 PPP3CBP16298 524 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 AHCYP23526 432 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 NTF4P34130 210 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ITGADQ13349 1161 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 DGCR6Q14129 220 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 EPHX4Q8IUS5 362 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 CDK20Q8IZL9 346 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 LINC01560Q8TB33 94 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF347Q96SE7 839 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ASB6Q9NWX5 421 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 UPB1Q9UBR1 384 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 NOX1Q9Y5S8 564 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 PKDREJQ9NTG1 2253 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 OR6C65A6NJZ3 312 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 MS4A18H0YCH9 400 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 OR7A10O76100 309 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ADAP00813 363 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ASAH2BP0C7U1 165 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 ADORA3P0DMS8 318 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 EPXP11678 715 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 FUT1P19526 365 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 MS4A18Q3C1V0 323 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 PXKQ7Z7A4 578 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 POMGNT2Q8NAT1 580 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 SEPHS2Q99611 448 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 MED18Q9BUE0 208 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 OR10A4Q9H209 315 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 RCE1Q9Y256 329 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 SH3D21A4FU49 640 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 CASKO14936 926 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 GSC2O15499 205 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 IGHV3-9P01782 118 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 IFI30P13284 250 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 IL32P24001 234 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 SSTR2P30874 369 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 FGD3Q5JSP0 725 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 SFRP5Q5T4F7 317 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 PGM2L1Q6PCE3 622 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC17Q8N6Y2 441 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-204ENST00000400919 STEAP2Q8NFT2 490 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms