RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372621.8

CTPS1-202, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS1, Length 3,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-202ENST00000372621 C4orf47A7E2U8 309 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 PSMD9O00233 223 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 LINC01565O15544 149 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 SULT1B1O43704 296 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 CSTAP01040 98 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 ENPP1P22413 925 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 GPR3P46089 330 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 PRPS1P60891 318 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 Q6ZSR6 202 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 FAM122BQ7Z309 247 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 BCORP1Q8N888 145 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 LRRC75AQ8NAA5 344 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 MOSPD2Q8NHP6 518 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 SLC37A2Q8TED4 501 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 ALG12Q9BV10 488 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 GLTPQ9NZD2 209 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 KLHL9Q9P2J3 617 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 KLK11Q9UBX7 282 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 OR5V1Q9UGF6 321 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 A0A1B0GUH1 482 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 IGF2P01344 180 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 ST6GAL1P15907 406 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 SNTA1Q13424 505 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 DEFB110Q30KQ9 67 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 TMEM31Q5JXX7 168 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 OLFML2AQ68BL7 652 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 SLC6A19Q695T7 634 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 LIPHQ8WWY8 451 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 Q9N2J8 555 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 FBXL3Q9UKT7 428 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 C10orf142B7Z368 130 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 MEN1O00255 615 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 CTNSO60931 367 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 UPK3AO75631 287 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 KRT33AO76009 404 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 GRPRP30550 384 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 SSTR2P30874 369 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 MNDAP41218 407 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 VEGFCP49767 419 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF81P51508 661 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 RPS15P62841 145 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 PUDPQ08623 228 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 DNM1P46Q6ZS02 220 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 SERPINA12Q8IW75 414 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 SUN5Q8TC36 379 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 RBP7Q96R05 134 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 MRI1Q9BV20 369 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 OR5K3A6NET4 321 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 PRAMEF2O60811 474 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 CALCBP10092 127 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 SLC25A1P53007 311 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 CLDN12P56749 244 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 KLHL26Q53HC5 615 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 LEG1Q6P5S2 330 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 STAC2Q6ZMT1 411 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 OR2T35Q8NGX2 323 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 C16orf52Q8NHV5 167 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 HAVCR1Q96D42 359 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 Q96M85 177 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 SEMA6CQ9H3T2 930 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 RXFP3Q9NSD7 469 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 HIF3AQ9Y2N7 669 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 TMEM131Q92545 1883 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 A0A1B0GVT2 93 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 ABHD16AO95870 558 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 RAB40ALP0C0E4 278 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 ADRA2CP18825 462 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 TPMTP51580 245 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 AP3S2P59780 193 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 FUT7Q11130 342 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 STX4Q12846 297 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 NNATQ16517 81 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 PRTGQ2VWP7 1150 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 CLLU1Q5K131 121 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-202ENST00000372621 FNDC7Q5VTL7 733 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms