RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 MS4A8Q9BY19 250 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ARL6Q9H0F7 186 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SLITRK2Q9H156 845 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PIGMQ9H3S5 423 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 BIN3Q9NQY0 253 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 MLXQ9UH92 298 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP13Q9UII6 198 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NINQ8N4C6 2090 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RAB19A4D1S5 217 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR5K4A6NMS3 321 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 F5H5P2 479 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SELENOFO60613 162 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RAD1O60671 282 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJB6O75190 326 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 HPP00738 406 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 UCHL1P09936 223 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CXCL2P19875 107 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 DRD1P21728 446 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 BSGP35613 385 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CD79BP40259 229 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 VEGFCP49767 419 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RAB8AP61006 207 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 IL10RAQ13651 578 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 IRF4Q15306 451 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ETFDHQ16134 617 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 LNX2Q8N448 690 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 BEST4Q8NFU0 473 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC107Q8WV48 283 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 MARC2Q969Z3 335 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RAB7BQ96AH8 199 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM19Q96E16 107 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 GIMAP5Q96F15 307 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CMC2Q9NRP2 79 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OPN4Q9UHM6 478 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CKAP5Q14008 2032 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OGG1O15527 345 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL18O94889 574 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 APOC3P02656 99 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 HPXP02790 462 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 WNT1P04628 370 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CSF1P09603 554 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 FOSL2P15408 326 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NT5EP21589 574 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 DRD5P21918 477 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SLC3A1Q07837 685 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 STX4Q12846 297 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ENPP2Q13822 863 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF345Q14585 488 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SZRD1Q7Z422 152 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 FAM129CQ86XR2 697 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR1S1Q8NH92 325 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 FANK1Q8TC84 345 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 THEM6Q8WUY1 208 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CHIAQ9BZP6 476 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 UBQLN3Q9H347 655 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 KCNK12Q9HB15 430 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CNIH4Q9P003 139 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 GPR34Q9UPC5 381 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.6□□□□□ -1.35
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