RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 AQP7P3A6NL99 342 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NR5A2O00482 541 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD51CO43502 376 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 UGT2B17O75795 530 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 AKR7A3O95154 331 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV2-5P01817 119 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 MYL2P10916 166 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SDC1P18827 310 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DRD4P21917 467 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PGM1P36871 562 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH3B1P43353 468 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GNG11P61952 73 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBA1BP68363 451 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBA4AP68366 448 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNJ10P78508 379 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CEACAM7Q14002 265 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0040Q15053 153 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GSG1Q2KHT4 349 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF385BQ569K4 471 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf87Q6PH81 154 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBA1AQ71U36 451 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 REC114Q7Z4M0 266 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM99Q8N816 258 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC58Q96CX6 371 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DUX5Q96PT3 197 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DPY30Q9C005 99 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 MKLN1Q9UL63 735 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ISPDA4D126 451 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf100A8MU93 164 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 FAAHO00519 579 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PIN1P1O15428 100 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC14BO60729 498 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ERLIN1O75477 346 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RP2O75695 350 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 UBL3O95164 117 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRM4P08173 479 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SBK3P0C264 359 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NAT2P11245 290 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CD79AP11912 226 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 IMPDH2P12268 514 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 BCKDHAP12694 445 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TACR3P29371 465 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CRYBB2P43320 205 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SELENOPP49908 381 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXA1P55317 472 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMK2DQ13557 499 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNTL6Q49A17 601 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 AVPI1Q5T686 147 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 LEG1Q6P5S2 330 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 EMBQ6PCB8 327 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 MDP1Q86V88 176 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CARM1Q86X55 608 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 YIPF5Q969M3 257 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.73□□□□□ -1.33
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