RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040783.10

Usp40-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp40, Length 5,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm19965J3QNY8 723 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 KitlgP20826 273 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Hoxc11P31313 304 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Foxred1Q3TQB2 487 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Wdr20Q3UWE6 569 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gcnt7Q3V3K7 433 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mc2rQ64326 296 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1115Q7TR53 326 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Sgpp2Q810K3 354 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zbtb42Q811H0 420 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Coq3Q8BMS4 370 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Unc119bQ8C4B4 251 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Akr7a2Q8CG76 367 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zc3h3Q8CHP0 950 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cbr3Q8K354 277 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Il17rcQ8K4C2 698 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr691Q8VGW5 322 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Med6Q921D4 246 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ppp6cQ9CQR6 305 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 BambiQ9D0L6 260 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tspan11Q9D1D1 253 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olig2Q9EQW6 323 aa7□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Iglc4A0A0G2JEK5 104 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dgat2l6A2ADU8 337 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 4931429L15RikE9PVU2 379 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn2r109K7N747 858 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 RaxO35602 342 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Best1O88870 551 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 P06321 130 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Hsd3b1P24815 373 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Adra2bP30545 450 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc12a3P59158 1002 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Casp3P70677 277 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 March9Q3TZ87 348 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rnase12Q5GAM8 145 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Znf354aQ61751 572 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Znf689Q8BKK5 500 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gpr152Q8BXS7 511 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Plekho2Q8K124 495 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gtf2f2Q8R0A0 249 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 MallQ91X49 154 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Lypd3Q91YK8 363 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Steap1Q9CWR7 339 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 1700080O16RikQ9D9G4 284 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Bbs10Q9DBI2 713 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ndufa9Q9DC69 377 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Clca3a2Q9EQR4 902 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc15a1Q9JIP7 709 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Map1bP14873 2464 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 A0A286YD13 301 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zfp69A2A761 587 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc25a25A2ASZ8 469 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zfp934K7N6H3 473 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gfra2O08842 464 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Camk2aP11798 478 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ccl4P14097 92 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Lef1P27782 397 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Pou3f4P62515 361 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gabrb3P63080 473 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 SirpaP97797 513 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tcf7Q00417 419 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Arhgef15Q5FWH6 849 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tas2r136Q7TQA8 305 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tas2r143Q7TQB9 293 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gpr119Q7TQP3 335 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cdk3Q80YP0 303 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dcaf12l2Q8BGW4 469 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc5a8Q8BYF6 611 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn1r231Q8R2A3 311 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn1r228Q8R2A7 333 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Socs7Q8VHQ2 579 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 PsphQ99LS3 225 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 CalyQ9DCA7 226 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 NpvfQ9ESQ8 188 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Pla2g2fQ9QZT4 168 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Asic5Q9R0Y1 495 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ice1E9Q286 2241 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm2022A0A1Y7VLT7 144 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cela3aA2A9U8 283 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Muc3E9PWP7 378 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zfp867E9Q2M4 473 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm20518E9Q548 580 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn2r60L7N2A1 853 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 PigfO09101 219 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 C9P06683 548 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cd38P56528 304 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vamp2P63044 116 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cnep1r1Q3UJ81 125 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rnf43Q5NCP0 784 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Alg8Q6P8H8 526 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Q8BR90 294 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Prkd2Q8BZ03 875 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Nedd4lQ8CFI0 1004 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Aimp2Q8R010 320 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Erlec1Q8VEH8 483 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr676Q8VGZ9 317 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cmtm3Q99LJ5 184 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.8 ms