RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610074.1

PCMTD2-210, Transcript of protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 2, human

TSL 4

Gene PCMTD2, Length 541 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCMTD2-210	ENST00000610074	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCMTD2-210	ENST00000610074	ARID1A	O14497	2285 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074		A0A1W2PQ72	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	DVL1	O14640	695 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	LDB3	O75112	727 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	CD48	P09326	243 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	IRF2	P14316	349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	PDHA2	P29803	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	PRDX2	P32119	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	STX2	P32856	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	PPP1R2	P41236	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	SLC1A3	P43003	542 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	HCAR3	P49019	387 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	PRRX1	P54821	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	SST	P61278	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	CTF1	Q16619	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	ACER2	Q5QJU3	275 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	EID3	Q8N140	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68	2e-7	■■■■■ 62.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	CALHM2	Q9HA72	323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	CR1	P17927	2039 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	GABRR3	A8MPY1	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	C17orf105	B2RV13	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074		H0Y8G0	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074		H0YIV9	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074		H3BMM5	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	KCNK1	O00180	336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	LGALS8	O00214	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	NME2P1	O60361	137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	GPR137B	O60478	399 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	SNX3	O60493	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	RHBDL1	O75783	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	PDE9A	O76083	593 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	SP1	P08047	785 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	FGF4	P08620	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	ACP2	P11117	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	TNNI3	P19429	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	MSH3	P20585	1137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	CXCR2	P25025	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	SLC1A6	P48664	564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	EMP2	P54851	167 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	ACTR3	P61158	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PCMTD2-210	ENST00000610074	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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