RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591107.6

NPC1-212, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 3

Gene NPC1, Length 890 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-212	ENST00000591107	POMP	Q9Y244	141 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	RNF212B	A8MTL3	300 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	GSTA4	O15217	222 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	SSX4	O60224	188 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	YES1	P07947	543 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	UBL4A	P11441	157 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	NCK1	P16333	377 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	OR3A2	P47893	321 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	MS4A2	Q01362	244 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	SKP2	Q13309	424 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ITGAD	Q13349	1161 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	PPA1	Q15181	289 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	GPR68	Q15743	365 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	PTOV1	Q86YD1	416 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	OR52N5	Q8NH56	324 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	RAB8B	Q92930	207 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ASB9	Q96DX5	294 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	GJE1	A6NN92	205 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107		H0YHG0	523 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	HMGN4	O00479	90 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ARPC2	O15144	300 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	CD5L	O43866	347 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	STAMBP	O95630	424 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	OR12D1	P0DN82	309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ARAF	P10398	606 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	GGT1	P19440	569 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ATP6V1B2	P21281	511 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	LCN1	P31025	176 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	MAGEA8	P43361	318 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF83	P51522	516 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ATP12A	P54707	1039 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	FLOT2	Q14254	428 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	P2RY6	Q15077	328 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ADRM1	Q16186	407 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	VMAC	Q2NL98	169 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107		Q6ZT83	130 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF527	Q8NB42	609 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	HSD17B8	Q92506	261 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	MAL2	Q969L2	176 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	MKLN1	Q9UL63	735 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	SERINC4	A6NH21	518 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107		H3BNH8	94 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	CXCR6	O00574	342 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ACOT8	O14734	319 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF264	O43296	627 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	FCMR	O60667	390 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	CYTIP	O60759	359 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	BCHE	P06276	602 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	THBS1	P07996	1170 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	CCNA2	P20248	432 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	COX5A	P20674	150 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	PCGF2	P35227	344 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	IDUA	P35475	653 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	DIO1	P49895	249 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ERF	P50548	548 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	PLAUR	Q03405	335 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	CHRNE	Q04844	493 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	RBBP4	Q09028	425 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	MERTK	Q12866	999 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	CBFB	Q13951	182 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	SCARB2	Q14108	478 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	MAPK14	Q16539	360 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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