RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 IL1RL1Q01638 556 aa11.15□□□□□ -0.62
SMARCE1-218ENST00000582955 P2RY6Q15077 328 aa11.15□□□□□ -0.62
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SMARCE1-218ENST00000582955 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.15□□□□□ -0.62
SMARCE1-218ENST00000582955 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SMARCE1-218ENST00000582955 WFDC8Q8IUA0 241 aa11.15□□□□□ -0.62
SMARCE1-218ENST00000582955 C10orf53Q8N6V4 93 aa11.15□□□□□ -0.62
SMARCE1-218ENST00000582955 S100PBPQ96BU1 408 aa11.15□□□□□ -0.62
SMARCE1-218ENST00000582955 PIK3IP1Q96FE7 263 aa11.15□□□□□ -0.62
SMARCE1-218ENST00000582955 CCT8L2Q96SF2 557 aa11.15□□□□□ -0.62
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SMARCE1-218ENST00000582955 OR10A4Q9H209 315 aa11.15□□□□□ -0.62
SMARCE1-218ENST00000582955 PARPBPQ9NWS1 579 aa11.15□□□□□ -0.62
SMARCE1-218ENST00000582955 ADA2Q9NZK5 511 aa11.15□□□□□ -0.62
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC7A7Q9UM01 511 aa11.15□□□□□ -0.62
SMARCE1-218ENST00000582955 RASD1Q9Y272 281 aa11.15□□□□□ -0.62
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SMARCE1-218ENST00000582955 CSMD2Q7Z408 3487 aa11.15□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 OR1E2P47887 323 aa11.14□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 KDM8Q8N371 416 aa11.14□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF417Q8TAU3 575 aa11.14□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 TMEM43Q9BTV4 400 aa11.14□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 PCDHAC1Q9H158 963 aa11.14□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 ASB6Q9NWX5 421 aa11.14□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 UPB1Q9UBR1 384 aa11.14□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.14□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.14□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 SIAH2O43255 324 aa11.13□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 FAM107AO95990 144 aa11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 THY1P04216 161 aa11.13□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 COX5AP20674 150 aa11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 IGHV1-2P23083 117 aa11.13□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 MXRA7P84157 204 aa11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 MFSD13AQ14CX5 517 aa11.13□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 WDR88Q6ZMY6 472 aa11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 CREB3L2Q70SY1 520 aa11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 FAM162AQ96A26 154 aa11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 TMEM45BQ96B21 275 aa11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.13□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 ABCD2Q9UBJ2 740 aa11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 TACC2O95359 2948 aa11.13□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 KRT33AO76009 404 aa11.12□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 SERPINA1P01009 418 aa11.12□□□□□ -0.63
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SMARCE1-218ENST00000582955 LTBQ06643 244 aa11.12□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 PMS2P3Q13401 168 aa11.12□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 TAB1Q15750 504 aa11.12□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 BEX5Q5H9J7 111 aa11.12□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.12□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 NIPAL3Q6P499 406 aa11.12□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 LINC00114Q6XXX2 140 aa11.12□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 VTCN1Q7Z7D3 282 aa11.12□□□□□ -0.63
SMARCE1-218ENST00000582955 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.12□□□□□ -0.63
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