RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC43A2Q8N370 569 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5J2Q8NH18 312 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMPDL3BQ92485 455 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 POTEKPQ9BYX7 375 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 NDEL1Q9GZM8 345 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 HIF3AQ9Y2N7 669 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR52Q9Y2T5 361 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTGES3LE9PB15 166 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 SURF4O15260 269 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR6A2O95222 327 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRHBPP24387 322 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRK5P34947 590 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 PMS2P3Q13401 168 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCTD21Q4G0X4 260 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALG10Q5BKT4 473 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 LNX2Q8N448 690 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSPAN14Q8NG11 270 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 MFSD8Q8NHS3 518 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 OTULINQ96BN8 352 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABHD17AQ96GS6 310 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q96MT0 163 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTTY12Q9BZ98 90 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 AMBNQ9NP70 447 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEC14L4Q9UDX3 406 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCKAP5O14513 1909 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1W2PNR3 127 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM166BA8MTA8 275 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 C11orf98E9PRG8 122 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC2A10O95528 541 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 F13BP05160 661 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC159P0C7I6 412 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADORA3P0DMS8 318 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 IMPDH2P12268 514 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP6V1B1P15313 513 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF17P17021 662 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 AHCYP23526 432 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD97P48960 835 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUDT6P53370 316 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDH15P55291 814 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTXN1P60606 82 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 CXCR4P61073 352 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 FOXK2Q01167 660 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYBPHQ13203 477 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 MFSD13AQ14CX5 517 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF540Q8NDQ6 660 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR6S1Q8NH40 331 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM163Q8TC26 289 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 SFXN2Q96NB2 322 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 TPRKBQ9Y3C4 175 aa15.52■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 M0R082 166 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF13O43567 381 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 SHC1P29353 583 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERVK-25P63136 954 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSNK2BP67870 215 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 SGCBQ16585 318 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM44Q2T9K0 475 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF417Q8TAU3 575 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRR1Q96L50 414 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 KATNB1Q9BVA0 655 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC400499M0QZD8 3231 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 FTCDNL1E5RQL4 147 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACOT7O00154 380 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ENTPD6O75354 484 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 SERPINI2O75830 405 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 UQCRC1P31930 480 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR2B6P58173 313 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 TEKQ02763 1124 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF566Q969W8 418 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR2B2Q9GZK3 357 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAS2R5Q9NYW4 299 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms