RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 NFS1Q9Y697 457 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 TRDCB7Z8K6 153 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ARPC5O15511 151 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 PSTPIP1O43586 416 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 NME2P1O60361 137 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 PRAMEF2O60811 474 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 PRAMEF11O60813 436 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ZMPSTE24O75844 475 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 PSMG1O95456 288 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 RAF1P04049 648 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 F7P08709 466 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 SBK3P0C264 359 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ELFN1P0C7U0 828 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 UROSP10746 265 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 CCL4P13236 92 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 CTSEP14091 401 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 DCTDP32321 178 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ARR3P36575 388 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 UQCRFS1P47985 274 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 CHRNB3Q05901 458 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ITGADQ13349 1161 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 RFX4Q33E94 735 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 CARD16Q5EG05 197 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 XKR6Q5GH73 641 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 Q5PR19 223 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 KCTD9Q7L273 389 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 VRK2Q86Y07 508 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 KMT5CQ86Y97 462 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 OR4K15Q8NH41 348 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 STT3BQ8TCJ2 826 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 KAT2AQ92830 837 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 SLC35C1Q96A29 364 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 TMEM125Q96AQ2 219 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 MMP25Q9NPA2 562 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 MYNNQ9NPC7 610 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 CHST11Q9NPF2 352 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ZNF225Q9UK10 706 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 F8P00451 2351 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 PDZD2O15018 2839 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 A0A0G2JMP0 313 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 AGAP5A6NIR3 686 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 MPTX1A8MV57 137 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 CLDN25C9JDP6 229 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 I6L893 689 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 OR10H3O60404 316 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 FAM155BO75949 473 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 TM7SF2O76062 418 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 AGFG2O95081 481 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 ACSL3O95573 720 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 CPNE6O95741 557 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 NDST3O95803 873 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 CD160O95971 181 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 CHRNGP07510 517 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 GABRR1P24046 479 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 IL12AP29459 219 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 GKP32189 559 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 SHMT2P34897 504 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 CDH15P55291 814 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 HERVK_113P63132 956 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 KLRB1Q12918 225 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 CSHL1Q14406 222 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 TRIP10Q15642 601 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 MTX3Q5HYI7 312 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-212ENST00000535535 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms