RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528704.1

ATG13-212, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 5

Gene ATG13, Length 574 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-212ENST00000528704 FRG2CA6NGY1 282 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CD8B2A6NJW9 211 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 C17orf105B2RV13 164 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 B4DXG7 233 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 LRRN3E7EW58 273 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 TO15178 435 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CTDSPLO15194 276 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 FOXS1O43638 330 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 DUX1O43812 170 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 OR2T1O43869 369 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 FZD7O75084 574 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 DNAJB6O75190 326 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 REM1O75628 298 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 SC5DO75845 299 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 OR2B3O76000 313 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 APOL3O95236 402 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 TXNDC12O95881 172 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 MT-ATP6P00846 226 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CD14P08571 375 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CT45A8P0DMV1 189 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CT45A9P0DMV2 189 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CD8BP10966 210 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CHRNB1P11230 501 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 SPNP16150 400 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 PGCP20142 388 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CXCR1P25024 350 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 PYCR1P32322 319 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 LTBRP36941 435 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 RFX2P48378 723 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 MMP15P51511 669 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 PNLIPRP2P54317 469 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 ZNF85Q03923 595 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 SLC3A1Q07837 685 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 C1orf61Q13536 156 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 DYRK1AQ13627 763 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CDK5R1Q15078 307 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 NINQ8N4C6 2090 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 TMEM99Q8N816 258 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 OR6S1Q8NH40 331 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 PATE1Q8WXA2 126 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 SLC7A6Q92536 515 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 SPACA7Q96KW9 195 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 C4orf36Q96KX1 117 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 MAP3K3Q99759 626 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 LRRC61Q9BV99 259 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 GON7Q9BXV9 100 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 NIPAL2Q9H841 368 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CAPN10Q9HC96 672 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 DIABLOQ9NR28 239 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CUTCQ9NTM9 273 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 SPATA2Q9UM82 520 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 ING4Q9UNL4 249 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG13-212ENST00000528704 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms