RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511273.1

CDH18-210, Transcript of cadherin 18, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CDH18, Length 2,318 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-210ENST00000511273 TMPRSS11DO60235 418 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 PTHP01270 115 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 TUBG1P23258 451 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 FASP25445 335 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 GATA4P43694 442 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 IRF8Q02556 426 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 UBXN1Q04323 297 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 WDFY2Q96P53 400 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 SIRPDQ9H106 197 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 NELFAQ9H3P2 528 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 TUBG2Q9NRH3 451 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 A0A1B0GVI7 797 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 SPOPO43791 374 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 KRT33AO76009 404 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 SNAP29O95721 258 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 PRPH2P23942 346 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 SLC6A2P23975 617 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 KCNJ1P48048 391 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 PITPNBP48739 271 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 ZNF81P51508 661 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 CCL8P80075 99 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 H3F3AP84243 136 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 PSG6Q00889 435 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 COX10Q12887 443 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 RAB39AQ14964 217 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 SULT1C3Q6IMI6 304 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 UBTD2Q8WUN7 234 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 PMM1Q92871 262 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 ITCHQ96J02 903 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 ZNF681Q96N22 645 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 EGFL8Q99944 293 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 ZNF702PQ9H963 129 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 ZFP57Q9NU63 452 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 FAM187AA6NFU0 413 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 H0YIV9 168 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 PEX14O75381 377 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 UBL3O95164 117 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 H6PDO95479 791 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 IMPDH2P12268 514 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 NMBRP28336 390 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 RGS6P49758 472 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 CORO7P57737 925 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 CBFBQ13951 182 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 HEPACAMQ14CZ8 416 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 KCNJ8Q15842 424 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 MSMPQ1L6U9 139 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 LIPJQ5W064 366 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 AAED1Q7RTV5 226 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 OR7G3Q8NG95 312 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 SAMD8Q96LT4 415 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 OR5B2Q96R09 309 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 DDOQ99489 341 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 POPDC3Q9HBV1 291 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 B3GNT2Q9NY97 397 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 SELENONQ9NZV5 590 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 PAK5Q9P286 719 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 PCDHGB4Q9UN71 923 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 A0A096LPK6 155 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 PRAMEF4O60810 478 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 IGHV3-9P01782 118 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 SBK2P0C263 348 aa5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CDH18-210ENST00000511273 DRD4P21917 467 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms