RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.75□□□□□ -0.53
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PRAME-213ENST00000492657 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.74□□□□□ -0.53
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PRAME-213ENST00000492657 TRAV6A0A075B6T7 132 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GVT2 93 aa11.73□□□□□ -0.53
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PRAME-213ENST00000492657 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 RHPN2P1A8MT19 583 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 PRR32B1ATL7 298 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa11.73□□□□□ -0.53
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PRAME-213ENST00000492657 ORC5O43913 435 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 SC5DO75845 299 aa11.73□□□□□ -0.53
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