RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 PDE5AO76074 875 aa23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 KRTAP10-9P60411 292 aa23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM69AQ5T7M9 428 aa23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD34AQ69YU3 496 aa23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 C5orf46Q6UWT4 87 aa23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 CBLL1Q75N03 491 aa23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGAP24Q8N264 748 aa23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM162AQ96A26 154 aa23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC41A3Q96GZ6 507 aa23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM43Q9BTV4 400 aa23.48■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRN3E7EW58 273 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 C16orf97H3BN30 126 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR171O14626 319 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 RASSF2P50749 326 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 LTBQ06643 244 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 FXNQ16595 210 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 SPATS1Q496A3 300 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 GPAT4Q86UL3 456 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 GABRG1Q8N1C3 465 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 OR9K2Q8NGE7 335 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 LZICQ8WZA0 190 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 PRSS27Q9BQR3 290 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 TESMINQ9Y4I5 508 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 M0R082 166 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 OR2T1O43869 369 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 BGLAPP02818 100 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 EPXP11678 715 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 GRPRP30550 384 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 TAS2R41P59536 307 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 TSC22D1Q15714 1073 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM225Q6GV28 225 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 GLYATQ6IB77 296 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 C22orf34Q6ZV56 151 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF100Q8IYN0 542 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 KDM8Q8N371 416 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF417Q8TAU3 575 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 MOGAT1Q96PD6 335 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 EPYCQ99645 322 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 MCCC2Q9HCC0 563 aa23.46■■□□□ 1.35
GTF3C4-202ENST00000483873 GSC2O15499 205 aa23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHV3-9P01782 118 aa23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 ZIC4Q8N9L1 334 aa23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 HSH2DQ96JZ2 352 aa23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 LRMDAQ9H2I8 198 aa23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 NDRG3Q9UGV2 375 aa23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 SNX13Q9Y5W8 968 aa23.45■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 ADAP00813 363 aa23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 CASP12Q6UXS9 341 aa23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 NKAIN4Q8IVV8 208 aa23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 DACH2Q96NX9 599 aa23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF426Q9BUY5 554 aa23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 RIMS3Q9UJD0 308 aa23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 LRBAP50851 2863 aa23.44■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 A6NNC1 897 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 OR5F1O95221 314 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 FUT4P22083 530 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 YAP1P46937 504 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 IFI44LQ53G44 452 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 Q6ZT83 130 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 OR6S1Q8NH40 331 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 APH1AQ96BI3 265 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 MPP4Q96JB8 637 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 MED18Q9BUE0 208 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 A4GNTQ9UNA3 340 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 RASD1Q9Y272 281 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 CSMD2Q7Z408 3487 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 PRR14LQ5THK1 2151 aa23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 J3KTA2 159 aa23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 ARPC2O15144 300 aa23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 PGM2L1Q6PCE3 622 aa23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 CREB3L2Q70SY1 520 aa23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM200AQ86VY9 491 aa23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 C10orf53Q8N6V4 93 aa23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 FANCFQ9NPI8 374 aa23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 B3GAT1Q9P2W7 334 aa23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 VAMP5O95183 116 aa23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 IFNW1P05000 195 aa23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4-202ENST00000483873 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms