RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460731.5

PTPN12-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 2

Gene PTPN12, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM162A	Q96A26	154 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	C3orf49	Q96BT1	292 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	MPP4	Q96JB8	637 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	ADGRG7	Q96K78	797 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	TIMP4	Q99727	224 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	NPAS1	Q99742	590 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	TRIM15	Q9C019	465 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	RELN	P78509	3460 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	DHRS12	A0PJE2	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	AHRR	A9YTQ3	701 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731		H3BNX3	289 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731		M0R3H8	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	FRS3	O43559	492 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	DNPH1	O43598	174 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	CHP2	O43745	196 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	KRT36	O76013	467 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	IFNW1	P05000	195 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	PEPD	P12955	493 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	GP1BB	P13224	206 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	UQCRB	P14927	111 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	ITGA2	P17301	1181 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	HK1	P19367	917 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	GDF1	P27539	372 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	TACR3	P29371	465 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	HOXC12	P31275	282 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	RFC3	P40938	356 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	OR1E2	P47887	323 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	CDH12	P55289	794 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	RAC3	P60763	192 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	COPZ1	P61923	177 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	HOXC5	Q00444	222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	PMP22	Q01453	160 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	MERTK	Q12866	999 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	SELENBP1	Q13228	472 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	AAGAB	Q6PD74	315 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731		Q6ZPA2	131 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	GHDC	Q8N2G8	530 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF614	Q8N883	585 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	MIB2	Q96AX9	1013 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	TPD52L3	Q96J77	140 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	PRRC1	Q96M27	445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF347	Q96SE7	839 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	MCHR1	Q99705	422 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	PIP5K1A	Q99755	562 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	PSD2	Q9BQI7	771 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	CHID1	Q9BWS9	393 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN12-209	ENST00000460731	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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