RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384546.1

RNU6-1160P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1160, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1160P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TOMM20Q15388 145 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CYTH1Q15438 398 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CHI3L2Q15782 390 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TTLL9Q3SXZ7 439 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DEFB134Q4QY38 66 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CBLN3Q6UW01 205 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HSDL2Q6YN16 418 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 VSTM4Q8IW00 320 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C15orf54Q8N8G6 183 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LINC01560Q8TB33 94 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CAMK2N2Q96S95 79 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 AP1M1Q9BXS5 423 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 FOLH1BQ9HBA9 442 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CLSPNQ9HAW4 1339 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 UGT2B17O75795 530 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IGHV3-43DP0DP04 118 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZNF250P15622 560 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ABOP16442 354 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TCP1P17987 556 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CYP2B6P20813 491 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NAMPTP43490 491 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RAB40BQ12829 278 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CARTPTQ16568 116 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SLC10A5Q5PT55 438 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZFP1Q6P2D0 407 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LINC00696Q6ZRV3 163 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 VPS36Q86VN1 386 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TMEM105Q8N8V8 129 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 APCDD1LQ8NCL9 501 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 OR1N2Q8NGR9 330 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PKMYT1Q99640 499 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 UVRAGQ9P2Y5 699 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 FBXW2Q9UKT8 454 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 STX8Q9UNK0 236 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZNF320A2RRD8 509 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 H0Y626 953 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DCTN6O00399 190 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HRES1P13985 223 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DCKP27707 260 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MYBPC1Q00872 1141 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GALK2Q01415 458 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 BCL7AQ4VC05 210 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HES5Q5TA89 166 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CES3Q6UWW8 571 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CASP12Q6UXS9 341 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C16orf62Q7Z3J2 963 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 FGF11Q92914 225 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DUSP16Q9BY84 665 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HOMER3Q9NSC5 361 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CCDC7Q96M83 1385 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LRRC30A6NM36 301 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C12orf71A8MTZ7 269 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 E7EQL1 145 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 H3BNH8 94 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZNF806P0C7X5 589 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PAICSP22234 425 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 BDNFP23560 247 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CXCL12P48061 93 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 OSTNP61366 133 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SLC7A9P82251 487 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SPP2Q13103 211 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RIPK1Q13546 671 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TYSND1Q2T9J0 566 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ADNP2Q6IQ32 1131 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ACSM5Q6NUN0 579 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 FAM47EQ6ZV65 393 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LPCAT2Q7L5N7 544 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NLRP9Q7RTR0 991 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 OR51G2Q8NGK0 314 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 OR13G1Q8NGZ3 307 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C17orf50Q8WW18 174 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HGDQ93099 445 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZNF607Q96SK3 696 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CCT7Q99832 543 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LINC00597Q9H2U6 94 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MYO9BQ13459 2157 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C12orf77C9JDV5 145 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms