RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 ZP1P60852 638 aa16.69■□□□□ 0.26
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SPNS3-201ENST00000355530 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.68■□□□□ 0.26
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SPNS3-201ENST00000355530 FOXS1O43638 330 aa16.67■□□□□ 0.26
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SPNS3-201ENST00000355530 BEX1Q9HBH7 125 aa16.67■□□□□ 0.26
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SPNS3-201ENST00000355530 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS3-201ENST00000355530 TGFBR3LH3BV60 316 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS3-201ENST00000355530 IMPA2O14732 288 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS3-201ENST00000355530 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SPNS3-201ENST00000355530 EGFP01133 1207 aa16.66■□□□□ 0.26
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