RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 E2F1Q01094 437 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF85Q03923 595 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 GGTLC2Q14390 218 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 NTRK2Q16620 822 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 LEG1Q6P5S2 330 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 JAZF1Q86VZ6 243 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 OR51L1Q8NGJ5 315 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 STK35Q8TDR2 534 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 S100ZQ8WXG8 99 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TAAR9Q96RI9 348 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TIMP4Q99727 224 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 CDADC1Q9BWV3 514 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 MMP27Q9H306 513 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 OCEL1Q9H607 264 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 ASB6Q9NWX5 421 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 A3GALT2U3KPV4 340 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1B0GVG6 124 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SLC30A4O14863 429 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TXNDC12O95881 172 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 IGHEP01854 428 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 BMP4P12644 408 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SDHAP31040 664 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 GABRA5P31644 462 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 IDUAP35475 653 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 DIO1P49895 249 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SLC35D3Q5M8T2 416 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 MFSD4AQ8N468 514 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 OR11G2Q8NGC1 345 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 M1APQ8TC57 530 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 ZNRF4Q8WWF5 429 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SLC25A36Q96CQ1 311 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TSPAN32Q96QS1 320 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 NPAS1Q99742 590 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 ZPBPQ9BS86 351 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 DDA1Q9BW61 102 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 OR11A1Q9GZK7 315 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 HMG20AQ9NP66 347 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 WIF1Q9Y5W5 379 aa11.27□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 KIF26BQ2KJY2 2108 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ITGA10O75578 1167 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 AHSA1O95433 338 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 DLGAP3O95886 979 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MSX1P28360 303 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SLC25A1P53007 311 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 DLX5P56178 289 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 BDH1Q02338 343 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 FOXF1Q12946 379 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 PON3Q15166 354 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 EMC4Q5J8M3 183 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 FAM69AQ5T7M9 428 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ARSKQ6UWY0 536 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 POMGNT2Q8NAT1 580 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 CT55Q8WUE5 264 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TM9SF2Q99805 663 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 PADI1Q9ULC6 663 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MPDZO75970 2070 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TFP02787 698 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MT-ND5P03915 603 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 CD63P08962 238 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 JMJD7P0C870 316 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 GRPRP30550 384 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SOX6P35712 828 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 FABP5Q01469 135 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 IL10RAQ13651 578 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SGCBQ16585 318 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 C22orf42Q6IC83 251 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 C5orf46Q6UWT4 87 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 NDUFAF7Q7L592 441 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 EXD3Q8N9H8 876 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 OR5J2Q8NH18 312 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 RELTQ969Z4 430 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 DTNBP1Q96EV8 351 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 CDC6Q99741 560 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 RERGLQ9H628 205 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 BABAM2Q9NXR7 383 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms