RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 H7C417 338 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PIN1P1O15428 100 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CSF1P09603 554 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 EPCAMP16422 314 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 BSGP35613 385 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 FXYD6P3P58550 94 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TGM3Q08188 693 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 ZNF124Q15973 351 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF425Q6IV72 752 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GAREM2Q75VX8 874 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 LNX2Q8N448 690 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SNX33Q8WV41 574 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC107Q8WV48 283 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MIB2Q96AX9 1013 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 C14orf79Q96F83 325 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 KLHL31Q9H511 634 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GNG8Q9UK08 70 aa6.65□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 A0A1B0GTQ1 180 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RNF222A6NCQ9 220 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 LRRC72A6NJI9 287 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMPRSS11DO60235 418 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CD8AP01732 235 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR4E1P0C645 316 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CALCBP10092 127 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PSMB10P40306 273 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 DEFA6Q01524 100 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CRMP1Q14194 572 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 AGERQ15109 404 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 LIN54Q6MZP7 749 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 Q6ZVL8 140 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR8S1Q8NH09 359 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 STOML3Q8TAV4 291 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OTUB2Q96DC9 234 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 A0A1W2PPE3 182 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NUDT19A8MXV4 375 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 WASH3PC4AMC7 463 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 H7BY64 318 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 FGF16O43320 207 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CTNSO60931 367 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PMS2P2O95744 297 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 AKAIN1P0CW23 69 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RNF224P0DH78 156 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SLC25A4P12235 298 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MAKP20794 623 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SDHAP31040 664 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CASRP41180 1078 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MAGEB1P43366 347 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ACTA2P62736 377 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ACTG2P63267 376 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MLC1Q15049 377 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SGCAQ16586 387 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ARL14Q8N4G2 192 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF561Q8N587 486 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR4C6Q8NH72 309 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SEC22AQ96IW7 307 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SPSB2Q99619 263 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MRI1Q9BV20 369 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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