RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261058.2

CCDC54-201, Transcript of coiled-coil domain containing 54, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CCDC54, Length 1,444 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC54-201ENST00000261058 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 A0A1B0GUH1 482 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 ESYT2A0FGR8 921 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 OR2AG2A6NM03 316 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 H0YL77 283 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 HAS3O00219 553 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 SDHDO14521 159 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 PFDN1O60925 122 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 SEMA3DO95025 777 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 GJB5O95377 273 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 TSPAN12O95859 305 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 CT45A10P0DMU9 189 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 CCNB1P14635 433 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 RAB4AP20338 218 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 NT5EP21589 574 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 SLC26A3P40879 764 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 RPS5P46782 204 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 RAP1GDS1P52306 607 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 GPX6P59796 221 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 SEC61GP60059 68 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 RAB4BP61018 213 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 RAB11AP62491 216 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 IL9RQ01113 521 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 PAX2Q02962 417 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 RUNX3Q13761 415 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 CRMP1Q14194 572 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 ANGPT1Q15389 498 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 TGIF1Q15583 401 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 RAB11BQ15907 218 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 SGCAQ16586 387 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 CNPY1Q3B7I2 92 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 CYBRD1Q53TN4 286 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 SLC25A25Q6KCM7 469 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 UTS2BQ765I0 119 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 COPS6Q7L5N1 327 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 ARHGAP18Q8N392 663 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 TBC1D19Q8N5T2 526 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 FNDC5Q8NAU1 212 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 OR5T1Q8NG75 326 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 GTSF1Q8WW33 167 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 PIGCQ92535 297 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 TOP1MTQ969P6 601 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 PANX1Q96RD7 426 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 OR51V1Q9H2C8 321 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 FBXO44Q9H4M3 255 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 NRBP2Q9NSY0 501 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 SMOXQ9NWM0 555 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 KLRF1Q9NZS2 232 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 LCMT1Q9UIC8 334 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 STAP1Q9ULZ2 295 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 PPIL1Q9Y3C6 166 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC54-201ENST00000261058 EEA1Q15075 1411 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 A0A1B0GVY2 172 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 TRABD2BA6NFA1 517 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 PDZK1P1A8MUH7 402 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 SLC17A2O00624 439 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 AIM2O14862 343 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 DFNA5O60443 496 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 CIAO1O76071 339 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 PGK1P00558 417 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 LAMP1P11279 417 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 FDFT1P37268 417 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 ALDH3B2P48448 385 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 KCNJ3P48549 501 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 SRYQ05066 204 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 HSDL1Q3SXM5 330 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 CCDC58Q4VC31 144 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 CGB2Q6NT52 195 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 SCYL2Q6P3W7 929 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 TMEM220Q6QAJ8 160 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 NAXDQ8IW45 347 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 CENPSQ8N2Z9 138 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC54-201ENST00000261058 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.34□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms