RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000084524.3

Prpf4-201, Transcript of U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prpf4, Length 5,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Ccdc106Q3ULM0 279 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 LpoQ5SW46 710 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr3Q60879 313 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Slc30a8Q8BGG0 367 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Fbxl22Q8C7B6 236 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Vwc2Q8C8N3 324 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 FntbQ8K2I1 437 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Nkd2Q8VE28 461 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr791Q8VGJ0 312 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Slc19a3Q99PL8 488 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Q9CPZ3 230 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Lamp5Q9D387 280 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Actl11Q9D5V1 1207 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 1700069L16RikQ9D9H5 109 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr945Q9EQB5 319 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Tbl1xQ9QXE7 527 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Wif1Q9WUA1 379 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Cd163l1A0A1B0GSB0 991 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Tmem200cJ3QK46 637 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Gm6803J3QPI8 144 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Zfp934K7N6H3 473 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Cnih2O35089 160 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Emp3O35912 163 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Capns1O88456 269 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 C1qbP14106 253 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Agtr1bP29755 359 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Hoxc5P32043 222 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Atp5j2P56135 88 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Map3k8Q07174 467 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Agbl5Q09M02 886 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Zfp872Q3UVL3 465 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Klri2Q5DT36 248 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 UnklQ5FWH2 727 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Havcr1Q5QNS5 305 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Pld6Q5SWZ9 221 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Gas6Q61592 674 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Apex2Q68G58 516 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr1101Q7TR59 310 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Coq4Q8BGB8 266 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr854Q8VFF1 315 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr1504Q8VFQ4 315 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Zfp65Q91W94 390 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Nudt21Q9CQF3 227 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Moxd1Q9CXI3 613 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Sorcs1Q9JLC4 1167 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Stub1Q9WUD1 304 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Nup188Q6ZQH8 1759 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr1034A0A1L1ST14 310 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr115B2RTB9 312 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 GlsD3Z7P3 674 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr68E9PYY2 315 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Tex264E9Q137 309 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Gm3727J3QM54 205 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr1221L7MU53 311 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Agr2O88312 175 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 LepP41160 167 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Mmp7Q10738 264 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 A1bgQ19LI2 512 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Foxred1Q3TQB2 487 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Ccdc190Q3URK1 288 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Elavl2Q60899 360 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Cd47Q61735 303 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Spaca9Q7TPM5 168 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Slitrk5Q810B7 957 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Plcxd3Q8BLJ3 321 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Med25Q8VCB2 745 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 L3hypdhQ9CXA2 354 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Rtl8bQ9D1F0 113 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Pnp2Q9D8C9 305 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 1700086D15RikQ9D9E9 151 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Pde7bQ9QXQ1 446 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Sema4gQ9WUH7 837 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Emc8O70378 207 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 GzmcP08882 248 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Il10P18893 178 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 ChrneP20782 493 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Hsd3b3P26150 373 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Gpr3P35413 330 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Ext1P97464 746 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Prelid2Q0VBB0 177 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 C130050O18RikQ497Y9 356 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Tfap2cQ61312 449 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr1167Q7TR26 316 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Plekhm1Q7TSI1 1074 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Dcaf12Q8BGZ3 453 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Cpne5Q8JZW4 593 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 GabrpQ8QZW7 440 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Egln2Q91YE2 419 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Macrod1Q922B1 323 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Abcg5Q99PE8 652 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Naalad2Q9CZR2 740 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Csnk1eQ9JMK2 416 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 HnrnpfQ9Z2X1 415 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Gm10271F6WY25 52 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Vmn2r66K7N6R9 851 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Gcm2O09102 504 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 P01810 119 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 P04214 136 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Dlx2P40764 332 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Sox3P53784 375 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.2 ms