RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PS29 197 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 RIIAD1A6NNX1 92 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 BCL2L11O43521 198 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 BNIP3LO60238 219 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 RDH16O75452 317 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 SOD2P04179 222 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 FOLR2P14207 255 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 MC3RP41968 323 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 EPHB3P54753 998 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 HES5Q5TA89 166 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 STK35Q8TDR2 534 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 SCLYQ96I15 445 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 IGSF21Q96ID5 467 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 C10orf90Q96M02 699 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 MFFQ9GZY8 342 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 APMAPQ9HDC9 416 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 V9GY05 133 aa9.09□□□□□ -0.95
HCG18-242ENST00000602319 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa9.09□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 H7C2Y5 167 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 K7ESM1 405 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 PPM1DO15297 605 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 XRCC3O43542 346 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 POP7O75817 140 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 RASGRP1O95267 797 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 CSF1P09603 554 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 BMP7P18075 431 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 AGTR1P30556 359 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 FAUP35544 74 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 PRKAG1P54619 331 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 PLAURQ03405 335 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 TAF12Q16514 161 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 LIN54Q6MZP7 749 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 ZNF813Q6ZN06 617 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 PGAP1Q75T13 922 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 SZRD1Q7Z422 152 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 COX14Q96I36 57 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 KLHL31Q9H511 634 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 BIN3Q9NQY0 253 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 TAS2R8Q9NYW2 309 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 TGM5O43548 720 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 OR2F2O95006 317 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 PAX6P26367 422 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 PSMB5P28074 263 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 SSR2P43308 183 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 OR2F1Q13607 317 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 SLC9A5Q14940 896 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 OR1Q1Q15612 314 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 CCDC157Q569K6 752 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 SLC35F2Q8IXU6 374 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 GINS4Q9BRT9 223 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 RNF122Q9H9V4 155 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 NCDNQ9UBB6 729 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 MOKQ9UQ07 419 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 TMEM218A2RU14 115 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 DUXAA6NLW8 204 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 FGF18O76093 207 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 KDM4BO94953 1096 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 SNAPINO95295 136 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 TOMM20Q15388 145 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.08□□□□□ -0.96
HCG18-242ENST00000602319 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms