RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R36Q96LQ0 422 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAM19Q9H013 955 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 PIF1Q9H611 641 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 CFAP73A6NFT4 308 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 B9A039 149 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 E9PBE3 544 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ITM2AO43736 263 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TYROBPO43914 113 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TGFAP01135 160 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CRYAAP02489 173 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4A8P0C604 315 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 UQCRBP14927 111 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PPOXP50336 477 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 P2RY4P51582 365 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NAAAQ02083 359 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 GNA13Q14344 377 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SQLEQ14534 574 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 EFNB3Q15768 340 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ADIPOQQ15848 244 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CARTPTQ16568 116 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CR1LQ2VPA4 569 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LIPNQ5VXI9 398 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 GPAT4Q86UL3 456 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF130Q86XS8 419 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC115Q96NT0 180 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SOX7Q9BT81 388 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PLK3Q9H4B4 646 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 BTNL2Q9UIR0 455 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 FRS3O43559 492 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT33AO76009 404 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LGI1O95970 557 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 IGLV1-44P01699 117 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PGRP06401 933 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CECR9P0C854 216 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 MYZAPP0CAP1 466 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 IL7RP16871 459 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CXCR1P25024 350 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 S100A3P33764 101 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SELENOPP49908 381 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LGALS3BPQ08380 585 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 GSTA3Q16772 222 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM225Q6GV28 225 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD16Q6P6B7 361 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 VHLLQ6RSH7 139 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LINGO2Q7L985 606 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NUDCD3Q8IVD9 361 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NELFAQ9H3P2 528 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LRP5LA4QPB2 252 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CDHR4A6H8M9 788 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC154A6NI56 674 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NR5A2O00482 541 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 VAMP5O95183 116 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 STAMBPO95630 424 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV3-15P01624 115 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SERPINE1P05121 402 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TACSTD2P09758 323 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 GKN3PP0CG01 181 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NR2F1P10589 423 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LBPP18428 481 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 GIFP27352 417 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CALCRP30988 508 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CDKN2CP42773 168 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms