RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DCAF7P61962 342 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRR23CQ6ZRP0 262 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUP54Q7Z3B4 507 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRRC75AQ8NAA5 344 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ENKURQ8TC29 256 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNRF4Q8WWF5 429 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR8D2Q9GZM6 311 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF121Q9H920 327 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C12orf10Q9HB07 376 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLHL1Q9NR64 748 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEMA5BQ9P283 1151 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC6A5Q9Y345 797 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP34Q70CQ2 3546 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HMX3A6NHT5 357 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TFECO14948 347 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRT8P05787 483 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRKAR1AP10644 381 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MST1P26927 711 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDOSTP39656 456 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STARD6P59095 220 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERVK-25P63136 954 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIRPAP78324 504 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HSF2Q03933 536 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GXYLT1Q4G148 440 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC58Q4VC31 144 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MZT2BQ6NZ67 158 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM122BQ7Z309 247 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 D2HGDHQ8N465 521 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DUSP18Q8NEJ0 188 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR1L3Q8NH93 324 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MOSPD2Q8NHP6 518 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZPLD1Q8TCW7 415 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RASD2Q96D21 266 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FRMD6Q96NE9 622 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MFRPQ9BY79 579 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXQ1Q9C009 403 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LAT2Q9GZY6 243 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MMP25Q9NPA2 562 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RASD1Q9Y272 281 aa15.06■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIOO75962 3097 aa15.05■□□□□ 0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1W2PRG6 482 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A8MUA0 341 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GLCEO94923 617 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ASAH2BP0C7U1 165 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM157BP0CG42 384 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPR2P20594 1047 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARL4DP49703 201 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GDI2P50395 445 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR10A3P58181 314 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFHR1Q03591 330 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EGR4Q05215 589 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LINC01590Q5TEZ4 76 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLXDC1Q8IUK5 500 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNX33Q8WV41 574 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 THAP4Q8WY91 577 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTRCQ99895 268 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NEK6Q9HC98 313 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NANSQ9NR45 359 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COPS3Q9UNS2 423 aa15.05■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IMPA2O14732 288 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LYRM1O43325 122 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DUX1O43812 170 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GATBO75879 557 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD14P08571 375 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAB3BP20337 219 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TALDO1P37837 337 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AQP2P41181 271 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC6A8P48029 635 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCR4P51679 360 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EFNA3P52797 238 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC25A1P53007 311 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 QPRTQ15274 297 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATAD3CQ5T2N8 411 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCAIQ8N9R8 606 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR13C5Q8NGS8 318 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPS4Y2Q8TD47 263 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ST6GAL2Q96JF0 529 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MOGAT1Q96PD6 335 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUDT9Q9BW91 350 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TTTY10Q9BZA0 68 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADAM19Q9H013 955 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms