RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-208	ENST00000556007	UGT2B17	O75795	530 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	GNA14	O95837	355 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	PIGR	P01833	764 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	FTH1	P02794	183 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	MMP1	P03956	469 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	LAMP1	P11279	417 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	MGMT	P16455	207 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	TNNI1	P19237	187 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	KITLG	P21583	273 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	IL18	Q14116	193 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	PPP1R7	Q15435	360 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF77	Q15935	545 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	DUSP7	Q16829	419 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	SBK1	Q52WX2	424 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	OR56B4	Q8NH76	319 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	KCNA7	Q96RP8	456 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	CLCC1	Q96S66	551 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	RAB34	Q9BZG1	259 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	PPA2	Q9H2U2	334 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	CUTC	Q9NTM9	273 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	BFAR	Q9NZS9	450 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007		Q9UF83	564 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	PHF11	Q9UIL8	331 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	STARD10	Q9Y365	291 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TIMM9-208	ENST00000556007	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007		A0A1B0GTQ1	180 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	IDS	B3KWA1	339 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	TEX46	H3BTG2	121 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	HSD17B6	O14756	317 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	LGALS2	P05162	132 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	MCF2	P10911	925 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	NPR2	P20594	1047 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	COX5A	P20674	150 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	IGHV1-2	P23083	117 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	TUBG1	P23258	451 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	OPRD1	P41143	372 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	PTGDS	P41222	190 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	MERTK	Q12866	999 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	ILK	Q13418	452 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	CARD16	Q5EG05	197 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	MARC1	Q5VT66	337 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	LRRC31	Q6UY01	552 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	PGAP1	Q75T13	922 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	UTS2B	Q765I0	119 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	MTURN	Q8N3F0	131 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	UFD1	Q92890	307 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	NUS1	Q96E22	293 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	OXGR1	Q96P68	337 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	RANBP9	Q96S59	729 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	CHIA	Q9BZP6	476 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	NUDT15	Q9NV35	164 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007	INSR	P06213	1382 aa		2.58	□□□□□ -2
TIMM9-208	ENST00000556007		A0A1B0GWB2	263 aa		2.57	□□□□□ -2

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