RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa5.8□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 LIPT2A6NK58 231 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 TRIM77I1YAP6 450 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 SCN2BO60939 215 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 IGKV3-15P01624 115 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 HLA-HP01893 362 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 INHBAP08476 426 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 NUDT7P0C024 238 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 OR12D1P0DN82 309 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 SAGP10523 405 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ATP6V1C1P21283 382 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 TACR3P29371 465 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 LCN1P31025 176 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 NPRL3Q12980 569 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 OR7A5Q15622 319 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 LEG1Q6P5S2 330 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 TIFABQ6ZNK6 161 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 USP43Q70EL4 1123 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 CREB3L2Q70SY1 520 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 RIMKLAQ8IXN7 391 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKFN1Q8N957 763 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 NUP37Q8NFH4 326 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM76AQ8TAV0 307 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 PIGXQ8TBF5 258 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM45BQ96B21 275 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 CCT7Q99832 543 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 NMUR2Q9GZQ4 415 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 RAB1BQ9H0U4 201 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 OR51I1Q9H343 314 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 MMP26Q9NRE1 261 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 RLIMQ9NVW2 624 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 B3GNT2Q9NY97 397 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM181Q9P2C4 612 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 B3GAT1Q9P2W7 334 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF69Q9UC07 566 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 AQP7P3A6NL99 342 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 GPR171O14626 319 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 PIP5K1BO14986 540 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 PPIHO43447 177 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 PEX11AO75192 247 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF432O94892 652 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 PRSS23O95084 383 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 MPZL1O95297 269 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 PNPP00491 289 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 HPRP00739 348 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 CRYAAP02489 173 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 CHRM4P08173 479 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM153BP0C7A2 387 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 GKN3PP0CG01 181 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 UROSP10746 265 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 BMP4P12644 408 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 CCL2P13500 99 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF35P13682 527 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 HLA-DOBP13765 273 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 PAFAH1B1P43034 410 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 MAGEA8P43361 318 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 GSTM5P46439 218 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 HOXC5Q00444 222 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 RELBQ01201 579 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 PIGFQ07326 219 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 SYPL1Q16563 259 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM153CQ494X1 144 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 KANK2Q63ZY3 851 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 NIPAL3Q6P499 406 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 NHLRC1Q6VVB1 395 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 GPAT4Q86UL3 456 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms