RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	OR3A1	P47881	315 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CAV2	P51636	162 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	TDGF1P3	P51864	188 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	TMPRSS3	P57727	454 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	ITPK1	Q13572	414 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	POU2AF1	Q16633	256 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	NRF1	Q16656	503 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC36A2	Q495M3	483 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CBLN3	Q6UW01	205 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	ASRGL1	Q7L266	308 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CROCCP2	Q86T23	111 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	FGFRL1	Q8N441	504 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	OR4K15	Q8NH41	348 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	ZFP90	Q8TF47	636 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	GLYATL1	Q969I3	302 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483		Q96MT0	163 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC30A3	Q99726	388 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	NEU3	Q9UQ49	428 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	MYH11	P35749	1972 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM72	A0PK05	275 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	PRR19	A6NJB7	356 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	RNF212B	A8MTL3	300 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	HPGDS	O60760	199 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CD3E	P07766	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CYP2D6	P10635	497 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	SELP	P16109	830 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	FGF7	P21781	194 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	KIR3DL1	P43629	444 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	HTR6	P50406	440 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CDKN2D	P55273	166 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	EMX2	Q04743	252 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	MGAT2	Q10469	447 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	HYAL1	Q12794	435 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	PCOLCE	Q15113	449 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	PRR27	Q6MZM9	219 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	COX15	Q7KZN9	410 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	BAP18	Q8IXM2	172 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	C4orf19	Q8IY42	314 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	PIGC	Q92535	297 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	SAR1A	Q9NR31	198 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CDH22	Q9UJ99	828 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	HHLA2	Q9UM44	414 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	MANBA	O00462	879 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	MSH4	O15457	936 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	ANXA9	O76027	345 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CDS2	O95674	445 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	GYPC	P04921	128 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CELA3B	P08861	270 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC6A1	P30531	599 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	EVX1	P49640	407 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	HMGCS2	P54868	508 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CLDN18	P56856	261 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2B8P	P59922	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	ECH1	Q13011	328 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	SEMA3B	Q13214	749 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	DOC2B	Q14184	412 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	TATDN3	Q17R31	274 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC190	Q86UF4	302 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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