RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 BPIFA2Q96DR5 249 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRB-209ENST00000550857 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ALG8Q9BVK2 526 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRB-209ENST00000550857 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.42□□□□□ -1.22
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PTPRB-209ENST00000550857 MTNR1AP48039 350 aa7.42□□□□□ -1.22
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