RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529524.1

PSMA1-208, Transcript of proteasome subunit alpha 1, human

TSL 3

Gene PSMA1, Length 743 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA1-208	ENST00000529524	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PTPN6	P29350	595 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	AXL	P30530	894 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	NTS	P30990	170 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SFN	P31947	248 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	AP1B1	Q10567	949 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	WASHC5	Q12768	1159 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TRDN	Q13061	729 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	EOGT	Q5NDL2	527 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524		Q8N9L7	120 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	FGF11	Q92914	225 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	NEIL2	Q969S2	332 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	HES7	Q9BYE0	225 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PRORY	Q9H606	182 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	NANOG	Q9H9S0	305 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	IL19	Q9UHD0	177 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	NFASC	O94856	1347 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	KNTC1	P50748	2209 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	APC2	O95996	2303 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		2.57	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PATJ	Q8NI35	1801 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PINLYP	A6NC86	204 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524		E9PMD0	336 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SGK494	L7N484	410 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	IMPA2	O14732	288 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TM9SF1	O15321	606 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	MMP23A	O75900	390 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	NDUFA7	O95182	113 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	NR2C1	P13056	603 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PRDX2	P32119	198 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC11A1	P49279	550 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	GPC3	P51654	580 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PSG7	Q13046	419 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PON2	Q15165	354 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PSMD5	Q16401	504 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TPGS2	Q68CL5	300 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ITFG1	Q8TB96	612 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TCEAL3	Q969E4	200 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PSMG2	Q969U7	264 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	FAM104A	Q969W3	186 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SDSL	Q96GA7	329 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	KRT23	Q9C075	422 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	FETUB	Q9UGM5	382 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		2.56	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524		H0YL77	283 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	DFNA5	O60443	496 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	MT-ATP6	P00846	226 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	BCKDHA	P12694	445 aa		2.55	□□□□□ -2

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